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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003284`

染色体: Chr07 坐标: 34584084-34585358 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003284`
名称	SmilChr07G003284
描述	uncharacterized SmilChr07G003284
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	34584084 - 34585358 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994150`
GeneID	`130994150`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994150`
原始查询	`LOC130994150`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger MYM-type-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826552]; symbol=AT4G09660; hit=AT4G09660; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	zinc finger MYM-type-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826552]; symbol=AT4G09660; hit=AT4G09660; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G09660` (AT4G09660) zinc finger MYM-type-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826552] identity=35.2; qcov=1.3; evalue=1.02e-72; confidence=medium
Rice	`Os02g0301400` - identity=36.6; qcov=0.626; evalue=3.79e-32; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14291 (DUF4371)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994150

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057775162.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057775162.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775162.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775162.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775162.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:34584129`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B108,B20,B76,D9
`Chr7:34584129`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B108,B20,B76,D9
`Chr7:34584142`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C35,C40
`Chr7:34584152`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B48,D5
`Chr7:34584184`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B4
`Chr7:34584184`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B4
`Chr7:34584294`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	99	A15,A25,A3,A4,A7,A9,B101,B102,B103,B105,B11,B117,B12,B120,B124,B127,B13,B130,B135,B137,B138,B14,B15,B17,B19,B2,B21,B22,B24,B29,B30,B31,B32,B34,B35,B40,B42,B43,B44,B45,B46,B48,B5,B50,B52,B54,B55,B56,B58,B61,B62,B65,B68,B69,B73,B85,B86,B87,B89,B9,B91,B96,B99,C1,C10,C12,C13,C14,C15,C16,C2,C20,C21,C22,C23,C26,C30,C33,C4,C44,C45,C47,C55,C59,C6,C62,C71,C74,C76,C80,C81,C82,C84,C85,C87,D11,D5,D6,D8
`Chr7:34584389`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	161	A1,A10,A11,A13,A14,A16,A18,A2,A20,A21,A23,A24,A25,A4,A5,B10,B100,B103,B106,B107,B108,B109,B110,B111,B112,B114,B115,B118,B119,B121,B122,B123,B126,B128,B129,B131,B132,B134,B135,B136,B137,B139,B140,B16,B19,B2,B20,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B33,B35,B36,B37,B41,B42,B43,B45,B47,B49,B50,B53,B56,B57,B58,B6,B60,B64,B66,B67,B68,B69,B7,B71,B74,B75,B76,B77,B79,B8,B81,B83,B85,B86,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C12,C14,C15,C17,C19,C23,C25,C27,C28,C29,C3,C31,C34,C36,C38,C4,C41,C43,C46,C48,C5,C53,C54,C56,C57,C58,C60,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C72,C73,C74,C75,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C85,C86,C87,D1,D10,D11,D2,D4,D7,D9
`Chr7:34584398`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B119,B132,C31,C41
`Chr7:34584819`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B119,B132,C31,C41
`Chr7:34584853`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	C35,C40
`Chr7:34584853`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	CDS_variant	2	C35,C40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775162.1

310 aa

155

310

DUF4371

PF14291 DUF4371 1-93 aa PF14291 DUF4371 92-138 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775162.1`	Pfam	`PF14291`	DUF4371	Domain	1	93	5.5e-57	193.7	ZMYM1/FAM200, RNase-like domain
`XP_057775162.1`	Pfam	`PF14291`	DUF4371	Domain	92	138	5.5e-57	193.7	ZMYM1/FAM200, RNase-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919179.1
ATGGCTTTTCGAGGACATGATGAGTCAGAAGAATCCTTGAACCAAGGAAATTTTATGGAGCTTTTGAAACTTTTGGCTTCTTGTAGCAAAGAGATATCTAATGTTGTATTGAAGAATGCTCCTGAAAACTTGAAACTTACATCACCTGACATTCAGAAAGATATCATAAATGCAATTGCAGTTGAGACTACAAGAGCTATCATTGATGATATTGGTAATGATTTTTTTGCCATATTAGTTGATGAATGTCGGGATGTGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994150
ATGGCTTTTCGAGGACATGATGAGTCAGAAGAATCCTTGAACCAAGGAAATTTTATGGAGCTTTTGAAACTTTTGGCTTCTTGTAGCAAAGAGATATCTAATGTTGTATTGAAGAATGCTCCTGAAAACTTGAAACTTACATCACCTGACATTCAGAAAGATATCATAAATGCAATTGCAGTTGAGACTACAAGAGCTATCATTGATGATATTGGTAATGATTTTTTTGCCATATTAGTTGATGAATGTCGGGATGTGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775162.1
MAFRGHDESEESLNQGNFMELLKLLASCSKEISNVVLKNAPENLKLTSPDIQKDIINAIAVETTRAIIDDIGNDFFAILVDECRDVSVKEQMVHVSDTIATSLEKGIGSLFSTYGLSISSLRGQGYDGASNMIGEFSGLKTLILIKRNPNAYYVHYFAHQLQLTIVVHAKNDDSQKSEAMNLLDVISRFEFVFVLHLMKKILGITHDLCQVLQRKEQDIVNAMKLVNVAKTRLQAMREKEWKMMLTDISKFCSRNEIEML...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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