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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003286`

染色体: Chr07 坐标: 34602181-34603106 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003286`
名称	SmilChr07G003286
描述	uncharacterized SmilChr07G003286
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	34602181 - 34603106 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994151`
GeneID	`130994151`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994151`
原始查询	`LOC130994151`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=28.8; qcov=0.996; evalue=4.52e-35; confidence=low
Rice	`Os06g0704400` - identity=31.6; qcov=1; evalue=4.76e-44; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03108 (DBD_Tnp_Mut); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994151

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775163.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775163.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775163.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775163.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057775163.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:34602192`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr7:34602309`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,C15,C17,C49
`Chr7:34602373`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	A1,B28,B95,C29,C54,C56,C57,C61
`Chr7:34602461`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B106
`Chr7:34602461`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B106
`Chr7:34602503`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	A20,B119,B132,C31,C41
`Chr7:34602503`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	5	A20,B119,B132,C31,C41
`Chr7:34602510`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	A22,B110,B113,B129,B47,B72,C24,C52,C59,C9
`Chr7:34602512`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B1,B101,B17,C70
`Chr7:34602532`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,D6
`Chr7:34602600`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B25,C6,C80
`Chr7:34602600`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B25,C6,C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775163.1

282 aa

141

282

DBD_Tnp_Mut

MULE

PF03108 DBD_Tnp_Mut 2-54 aa PF10551 MULE 196-282 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775163.1`	Pfam	`PF03108`	DBD_Tnp_Mut	Family	2	54	2.1e-07	31.2	MuDR family transposase
`XP_057775163.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	196	282	4.5e-10	40.5	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919180.1
ATGACCTTTGCAGGGGCAAAGGAGGCTAGGGAATCAATAAATGCATATGCTGTGAAGTTTGGGTACAAGTTAAAGTTCATAAAGAATGAAAAGACTAGGATTAGAGTGGTTTGCATCAATGACCAAGCATGTCCATTTCTCATGCATGTCTCTAAAGATGGGGACATTGAAGGGCTAGCCATCAAGACTCTTGTGGCAGATCACACCTGCTACAAACAGAGGGAAGTCCCCAGTGTTAGTCAAACATACTTGGCTAAGTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994151
ATGACCTTTGCAGGGGCAAAGGAGGCTAGGGAATCAATAAATGCATATGCTGTGAAGTTTGGGTACAAGTTAAAGTTCATAAAGAATGAAAAGACTAGGATTAGAGTGGTTTGCATCAATGACCAAGCATGTCCATTTCTCATGCATGTCTCTAAAGATGGGGACATTGAAGGGCTAGCCATCAAGACTCTTGTGGCAGATCACACCTGCTACAAACAGAGGGAAGTCCCCAGTGTTAGTCAAACATACTTGGCTAAGTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775163.1
MTFAGAKEARESINAYAVKFGYKLKFIKNEKTRIRVVCINDQACPFLMHVSKDGDIEGLAIKTLVADHTCYKQREVPSVSQTYLAKYFKEAIYRNPRFTSKDIQGHVKDHLKLHVSLHKCKRAKKEIICKLEGSYREEFNRLVAYCNIVKECMPGSKMKLQLSTEHLQLQMRVFKRIFVLLEPCRVNWIGGCRPIISLDGFHLKCKTFGVLLTAVGKNGNDGIVPIAWAVVNKENKNNRRWFLGWLRQELNLGTGDEVTL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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