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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003559`

染色体: Chr01 坐标: 54199602-54203213 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003559`
名称	SmilChr01G003559
描述	small GTPase LIP1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	54199602 - 54203213 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994165`
GeneID	`130994165`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994165`
原始查询	`LOC130994165`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	small GTPase LIP1-like
产物	small GTPase LIP1-like
Arabidopsis	`AT5G64813` (LIP1) Ras-related small GTP-binding family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836603] identity=75.7; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0135200` - identity=66.7; qcov=0.955; evalue=3.22e-141; confidence=high
GO	GO:0003924 (GTPase activity); GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0012505 (endomembrane system)
KEGG	-
Pfam	PF00025 (Arf); PF00071 (Ras); PF08477 (Roc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994165

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057775183.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057775183.1`
3	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.80000	`XP_057775183.1`
4	Endocytic vesicle	Endocytic vesicle	0.20000	`XP_057775183.1`
5	Clathrin-coated vesicle	Clathrin-coated vesicle	0.20000	`XP_057775183.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:54200367`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B139,B28,B32,C79
`Chr1:54201398`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr1:54201860`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,C38,C75,C76,C83
`Chr1:54202002`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr1:54202410`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr1:54202448`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,C2,C86
`Chr1:54202748`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr1:54202773`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr1:54202822`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B73,C33,C41,C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775183.1

336 aa

168

336

Arf

Roc

Ras

PF00025 Arf 23-125 aa PF08477 Roc 25-138 aa PF00071 Ras 25-176 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775183.1`	Pfam	`PF00025`	Arf	Domain	23	125	5.6e-06	26.6	ADP-ribosylation factor family
`XP_057775183.1`	Pfam	`PF08477`	Roc	Domain	25	138	3.3e-18	66.8	Ras of Complex, Roc, domain of DAPkinase
`XP_057775183.1`	Pfam	`PF00071`	Ras	Domain	25	176	3.2e-16	60.1	Ras family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919200.1
TGAAAGTGTAATTAAACAAAACTTTTAAACACCGCCAAAAGTCGCATTTGATGAGCAACTGTAGTCGTGTTTCTTTAGCAATCCCAAATCCAACCGTTCAAACTGTCGATCAAAATGCATAATTTCCGATCCCAAATGCTTCCAACTCAAAATCACTGTCGGCAGCTGAAGCAATCCCATCTTAGATCGCTCCTATTTAATCTCTGTGATTTCCGCGCAAGCGTAGAAACTCATTACCCGCTAGATTTTCGAAGGAAATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994165
ATGTTTTGGAGGGAGAGAGATAGGGAGAGGGAGATCAAAGAGCAAAATGGTGGGCCACCTGTTGGGCAGGTCAGGGTGCTTGTTGTTGGGGACTCAGGTGTCGGTAAGACTTCTCTTGTTCATCTGATAATGAAAGGTTCTTCCGTTTCTCGCCCTTCTCAAACTGTTGGTTGTAGCGTAAGTGTTAAGCATACAACCTATGGAAATTCTGGTAGCTCGTCTAGTAGCTTGAAAGGTGAGTCTGAGAGAGACTTTTTTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775183.1
MFWRERDREREIKEQNGGPPVGQVRVLVVGDSGVGKTSLVHLIMKGSSVSRPSQTVGCSVSVKHTTYGNSGSSSSSLKGESERDFFVELWDISGHERYKDCRSLFYSQINGVVFVHDRSQRRTKSSLQKWAAEIAATGTFSAPLASGGPGGLPVPYIVVGNKADIAPKEGTRVSSGNLVDVAREWAEKQGLLPQSEELPLVESFPSGGGLIAAAKEARYDKEAVMKFFKMLIRRRYFSDELPGAAPWSTPNSRPMPQSGE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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