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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003355`

染色体: Chr07 坐标: 36041461-36041949 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003355`
名称	SmilChr07G003355
描述	uncharacterized SmilChr07G003355
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	36041461 - 36041949 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994166`
GeneID	`130994166`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994166`
原始查询	`LOC130994166`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0256300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os11g0256300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os11g0256300` - identity=41.4; qcov=0.511; evalue=2.16e-12; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF06839 (Zn_ribbon_GRF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994166

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057775181.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057775181.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057775181.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775181.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775181.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:36041526`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,B71,C64,C66
`Chr7:36041547`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr7:36041554`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	23	A20,B102,B105,B11,B115,B124,B16,B17,B20,B48,B6,B64,B65,B81,B98,C24,C44,C5,C64,C66,C76,C80,D1
`Chr7:36041559`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C23
`Chr7:36041586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B13,B23,C64,C66
`Chr7:36041586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B23,C64,C66
`Chr7:36041666`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,B14
`Chr7:36041677`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	32	A10,A13,A16,A18,A24,B118,B12,B125,B126,B129,B130,B134,B2,B45,B46,B56,B64,B74,B96,C17,C2,C21,C28,C36,C54,C58,C59,C71,C73,C83,D4,D9
`Chr7:36041685`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	A3,B109,B137,B3,B58,B6,B61,B69,B72,B79,C30,C67,D6
`Chr7:36041690`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B131
`Chr7:36041690`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr7:36041701`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C18,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775181.1

137 aa

137

Zn_ribbon_GRF

PF06839 Zn_ribbon_GRF 21-55 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775181.1`	Pfam	`PF06839`	Zn_ribbon_GRF	Domain	21	55	3.9e-07	30.8	GRF zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919198.1
ATGGAGAACGAATCTGAGGTGATGTATTGTCATTGCGAAATTGGAAGCAAGAGGTTGAAAGCTTTGAGAATGACTTCATGGACGAACGATATTCCGGGGAGAAGGTTCTATGGGTGTAGAAATTGGAAGACCAAAAATTGTGGTTTTTTTGATTGGTATGATGAACCAATGTCTGAGAGAGCTAGGGAAGTTATTAACCATTTGAAGAATGAAAATATGAAGCTTGTGAAGATGCATGAAAATTCGACCCCACCCATGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994166
ATGGAGAACGAATCTGAGGTGATGTATTGTCATTGCGAAATTGGAAGCAAGAGGTTGAAAGCTTTGAGAATGACTTCATGGACGAACGATATTCCGGGGAGAAGGTTCTATGGGTGTAGAAATTGGAAGACCAAAAATTGTGGTTTTTTTGATTGGTATGATGAACCAATGTCTGAGAGAGCTAGGGAAGTTATTAACCATTTGAAGAATGAAAATATGAAGCTTGTGAAGATGCATGAAAATTCGACCCCACCCATGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775181.1
MENESEVMYCHCEIGSKRLKALRMTSWTNDIPGRRFYGCRNWKTKNCGFFDWYDEPMSERAREVINHLKNENMKLVKMHENSTPPMDIEAEIGHLRTEVEAWKEESRVVRRKSRFLIIVLIISWFVMMKRLKVVMPK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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