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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003370`

染色体: Chr07 坐标: 36379794-36381174 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003370`
名称	SmilChr07G003370
描述	uncharacterized SmilChr07G003370
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	36379794 - 36381174 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994170`
GeneID	`130994170`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994170`
原始查询	`LOC130994170`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0643050; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os03g0643050; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G35695` (AT5G35695) nuclease HARBI1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833543] identity=48.5; qcov=0.315; evalue=1.71e-26; confidence=low
Rice	`Os03g0643050` - identity=44; qcov=0.506; evalue=1.81e-36; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4); PF26138 (DUF8040)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994170

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775185.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057775185.1`
3	Telomere	端粒	0.40000	`XP_057775185.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775185.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775185.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:36379854`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C74
`Chr7:36379854`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr7:36379906`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr7:36379907`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:36379925`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,C2,C27,C30,C42
`Chr7:36379937`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B136
`Chr7:36379937`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B136
`Chr7:36379945`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B20,B92,C33
`Chr7:36379985`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr7:36379990`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	21	B107,B12,B128,B133,B17,B22,B41,B71,B73,B8,B89,B96,B97,C19,C46,C49,C5,C61,C64,C80,C85
`Chr7:36379993`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B33
`Chr7:36379993`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775185.1

314 aa

157

314

DUF8040

DDE_Tnp_4

Plant_tran

PF26138 DUF8040 64-144 aa PF13359 DDE_Tnp_4 155-252 aa PF04827 Plant_tran 197-255 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775185.1`	Pfam	`PF26138`	DUF8040	Domain	64	144	1.5e-15	57.5	Domain of unknown function (DUF8040)
`XP_057775185.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	155	252	3.5e-12	46.9	DDE superfamily endonuclease
`XP_057775185.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	197	255	7.8e-06	26.4	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919202.1
ATGACAAACACATCCATTAACAAGAAAGTTGTGGCTTGGATGATTGAGGAAGTTATGCGTCAATTTTACAACCAACTAGTCGTTATTATAGAAGTAATCATTAGGCTGAAATCCTATAAGAGAAAACGTGGCTGCGAGTCTCAGCCTTACAGCTATATAGCTCAGATTCCCGATCAAGTAAAGCACTTAAACCGATTAACTAATGTTAGTGATGTAGATTGTATACTCAATCTAAGGATGGACCGCAACACATTCGGTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994170
ATGACAAACACATCCATTAACAAGAAAGTTGTGGCTTGGATGATTGAGGAAGTTATGCGTCAATTTTACAACCAACTAGTCGTTATTATAGAAGTAATCATTAGGCTGAAATCCTATAAGAGAAAACGTGGCTGCGAGTCTCAGCCTTACAGCTATATAGCTCAGATTCCCGATCAAGTAAAGCACTTAAACCGATTAACTAATGTTAGTGATGTAGATTGTATACTCAATCTAAGGATGGACCGCAACACATTCGGTCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775185.1
MTNTSINKKVVAWMIEEVMRQFYNQLVVIIEVIIRLKSYKRKRGCESQPYSYIAQIPDQVKHLNRLTNVSDVDCILNLRMDRNTFGRKQLGSLDDGRYVSLEEQVAMFLSILAHHKKNRIVYFDFWRSGQTISHYVHIVLKTILKIHVLLLVKPQPVPEEWNYYLVDCGYANSEGFLAPYKGVCYHLKEWGPINARPQNAEELFNLRHAKARNVIERAFGILKMRWAALRSTTYYPIKVQVRLIMACVLLKNFIRSNMAI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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