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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003373`

染色体: Chr07 坐标: 36405756-36406779 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003373`
名称	SmilChr07G003373
描述	uncharacterized SmilChr07G003373
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	36405756 - 36406779 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994171`
GeneID	`130994171`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994171`
原始查询	`LOC130994171`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PIF1 helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824333]; symbol=AT3G51700; hit=AT3G51700; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	PIF1 helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824333]; symbol=AT3G51700; hit=AT3G51700; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G51700` (AT3G51700) PIF1 helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824333] identity=43.7; qcov=0.962; evalue=1.15e-73; confidence=medium
Rice	`Os04g0206200` - identity=44.9; qcov=0.611; evalue=7.46e-44; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF21530 (Pif1_2B_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994171

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775186.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057775186.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775186.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775186.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775186.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:36405757`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B29,C57
`Chr7:36405777`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B45,B77,C29,C52,C57
`Chr7:36405785`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr7:36405788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,C61
`Chr7:36405804`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B101,B115
`Chr7:36405804`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B101,B115
`Chr7:36405830`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,B22,C71
`Chr7:36405831`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr7:36405845`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B65,C39
`Chr7:36405851`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	39	A18,A5,A8,B10,B105,B107,B108,B109,B113,B119,B122,B129,B130,B135,B138,B14,B140,B31,B49,B55,B59,B62,B7,B70,B79,B81,B82,B84,B91,C13,C25,C29,C36,C40,C55,C71,C72,C80,D4
`Chr7:36405869`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr7:36405879`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,C48,C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775186.1

288 aa

144

288

Pif1_2B_dom

PF21530 Pif1_2B_dom 125-171 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775186.1`	Pfam	`PF21530`	Pif1_2B_dom	Domain	125	171	6.2e-24	84.2	DNA helicase Pif1, 2B domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919203.1
ATGGGCTTCGGTGCTGAAGCTGTGGAGTTGGAAGAGTTCTCTAAATGGATTGCGAGTATAGGCGATGGAACAATTGGAAGTGCGAATGATGGTAATGTCAATATTGATATTCGAACAGATTTTTTGATAAAATGGTCTGGAAATCCAATTGAGCACATAGTTAACACCATTTATCCATCAGATTGTTCCAATAATGTAGATACAAGTTATCTACAAGAGAGAGCAATACTTGCTCCTACTCTTAATGCTGTTGAATCTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994171
ATGGGCTTCGGTGCTGAAGCTGTGGAGTTGGAAGAGTTCTCTAAATGGATTGCGAGTATAGGCGATGGAACAATTGGAAGTGCGAATGATGGTAATGTCAATATTGATATTCGAACAGATTTTTTGATAAAATGGTCTGGAAATCCAATTGAGCACATAGTTAACACCATTTATCCATCAGATTGTTCCAATAATGTAGATACAAGTTATCTACAAGAGAGAGCAATACTTGCTCCTACTCTTAATGCTGTTGAATCTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775186.1
MGFGAEAVELEEFSKWIASIGDGTIGSANDGNVNIDIRTDFLIKWSGNPIEHIVNTIYPSDCSNNVDTSYLQERAILAPTLNAVESVNQYMISLNKSEGRLYRSSDSTSRSDSITDLVQQVHTPEFLNSIKCSGLPNHEIYLKVGTPVMLLRNIDHANGLCNGTRLKITRLGQHVLEAQILTRDNANTKILIPRMSLTPADPRLPFKFERRQFPLIVSYAMTINKSQGQSFSHVGLFLPRPVFTHGQLYVAVSRVRSRAG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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