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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003400`

染色体: Chr07 坐标: 36905387-36906181 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003400`
名称	SmilChr07G003400
描述	uncharacterized SmilChr07G003400
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	36905387 - 36906181 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994183`
GeneID	`130994183`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994183`
原始查询	`LOC130994183`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribosomal protein L1p/L10e family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818865]; symbol=AT2G42650; hit=AT2G42650; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Ribosomal protein L1p/L10e family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818865]; symbol=AT2G42650; hit=AT2G42650; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G42650` (AT2G42650) Ribosomal protein L1p/L10e family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818865] identity=43; qcov=0.917; evalue=1.36e-59; confidence=medium
Rice	`Os05g0558000` - identity=38.7; qcov=0.754; evalue=1.58e-36; confidence=medium
GO	GO:0030686 (90S preribosome)
KEGG	-
Pfam	PF00687 (Ribosomal_L1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994183

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775199.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057775199.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775199.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775199.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775199.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:36905465`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B25,B29,B71,C6
`Chr7:36905815`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr7:36905899`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B82
`Chr7:36905899`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr7:36905986`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775199.1

264 aa

132

264

Ribosomal_L1

PF00687 Ribosomal_L1 37-238 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775199.1`	Pfam	`PF00687`	Ribosomal_L1	Domain	37	238	4.9e-39	134.7	Ribosomal protein L1p/L10e family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919216.1
ATGGCCGTACCTTCGAGAGATCGAATCAACGTCGACAGCGTCCGGAAAGCCACCAACGCCCTCCTCAAGTGGAAGAAGAAGTCACTCCTCTCCCACGACGCTATTGAAGAAGAAGCCGACGATTTCATCTACCTCTCCGTAACCCTAAAAAAAGTCCCGCCGCGCAACCTCTCCGTCACTCCGCACCGAATCCTCCTCCGCCGCCCGCTTCTGTCTCAGGACTTGTCCACCTTGAACATCTGCCTCATCGTCGACGGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994183
ATGGCCGTACCTTCGAGAGATCGAATCAACGTCGACAGCGTCCGGAAAGCCACCAACGCCCTCCTCAAGTGGAAGAAGAAGTCACTCCTCTCCCACGACGCTATTGAAGAAGAAGCCGACGATTTCATCTACCTCTCCGTAACCCTAAAAAAAGTCCCGCCGCGCAACCTCTCCGTCACTCCGCACCGAATCCTCCTCCGCCGCCCGCTTCTGTCTCAGGACTTGTCCACCTTGAACATCTGCCTCATCGTCGACGGAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775199.1
MAVPSRDRINVDSVRKATNALLKWKKKSLLSHDAIEEEADDFIYLSVTLKKVPPRNLSVTPHRILLRRPLLSQDLSTLNICLIVDGKRITAESAQKILQAQGIPYIKKVFKLSKLKSDFNSFESKKKLHDSFDVFLADKSVEAVLPKVLGRVFYKKRKKIPVAVELGGDWKEELERACRTSLWCLSGGTCSAVRVGRLGAMEAQEIVENVYDAVDGVVEIVPRKWSGIRCLHLKFSDSLALPIYEDEIQDGSLLGLKRKR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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