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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003521`

染色体: Chr01 坐标: 53851598-53855012 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003521`
名称	SmilChr01G003521
描述	5'-3' exoribonuclease 2-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	53851598 - 53855012 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994191`
GeneID	`130994191`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994191`
原始查询	`LOC130994191`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	5'-3' exoribonuclease 2-like
产物	5'-3' exoribonuclease 2-like
Arabidopsis	`AT1G76010` (AT1G76010) Alba DNA/RNA-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843932] identity=58.5; qcov=0.968; evalue=2.88e-72; confidence=high
Rice	`Os09g0542000` - identity=77.1; qcov=0.453; evalue=8.99e-71; confidence=medium
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF01918 (Alba); PF12328 (Rpp20)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994191

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057775208.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057775208.1`
3	Nucleolus	核仁	0.20000	`XP_057775208.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057775208.1`
5	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057775208.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:53852989`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B128,B15
`Chr1:53853000`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr1:53854086`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26
`Chr1:53854658`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775208.1

309 aa

154

309

Alba

Rpp20

PF01918 Alba 19-83 aa PF12328 Rpp20 41-110 aa

XP_057775210.1

309 aa

154

309

Alba

Rpp20

PF01918 Alba 19-83 aa PF12328 Rpp20 41-110 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775208.1`	Pfam	`PF01918`	Alba	Domain	19	83	6e-21	74.7	Alba
`XP_057775208.1`	Pfam	`PF12328`	Rpp20	Family	41	110	1.2e-05	26.0	Rpp20 subunit of nuclear RNase MRP and P
`XP_057775210.1`	Pfam	`PF01918`	Alba	Domain	19	83	6e-21	74.7	Alba
`XP_057775210.1`	Pfam	`PF12328`	Rpp20	Family	41	110	1.2e-05	26.0	Rpp20 subunit of nuclear RNase MRP and P

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919225.1
GCTTTTGGGCTGGGACTATAAATAGCTGCGGAGCACGCAGCTAAATGGTCGGGAGGTAAGTAACGAAGAAACGAAGCCGGAGAAGAGGGCTTTCCCTTTTGAGCAGCATATCGTCCCGTCCTTCCGTATACAACTACGTACGCGTACACCTCCTCGAGAGCTATGGATCGGTACCAGAAGGTGGAGAAGCCGAAGGTAGAGACGCCAATCGATGAGAATGAAATTCGGATTACAAGCCAGGGCAGGATGCGAAGCTACAT...

XM_057919227.1
GTAAGTAACGAAGAAACGAAGCCGGAGAAGAGGGCTTTCCCTTTTGAGCAGCATATCGTCCCGTCCTTCCGTATACAACTACGTACGCGTACACCTCCTCGAGGTATTTCATGCGTGTGGTTTGTGTTTGTTACATTTTCAGGTGTTCCGAATCATTAATTGCGGATCTGTTGCTCTTGTTTTCACCAACATAAACCCTAGCTGTCGGTCGTTGTTCGTCGCACTTTTTGTTTCACATATTGCATGTGCTCAGCTTAGCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130994191
ATGGATCGGTACCAGAAGGTGGAGAAGCCGAAGGTAGAGACGCCAATCGATGAGAATGAAATTCGGATTACAAGCCAGGGCAGGATGCGAAGCTACATCACTTACGCCATGACTCTGCTTCAGGAAAAGGGCTCAGATGAAGTAGTATTCAAGGCAATGGGCAGAGCCATCAATAAAACTGTTACAATTGTGGAGTTAATCAAGAGGAGAATTGTTGGTCTTCACCAAATTACAGCAATTCAATCCACTGATATAACTGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057775208.1
MDRYQKVEKPKVETPIDENEIRITSQGRMRSYITYAMTLLQEKGSDEVVFKAMGRAINKTVTIVELIKRRIVGLHQITAIQSTDITDTWEPLEEGLQILETTRKVSMVTITLSKKDLDMNNVGYQPPIPADQVKVSTELEYDGEGSPIGRGRGRGGRGRGRPRGGPAGNGYAPAEFDDGGYDRNRGYPRGRGRGRGRNFRGRGRGGYYQSDAQNDAGGRGRGGYYQSDAQNDAGGRGRGGYYQSDAQNDAGGRGRGGYYQ...

XP_057775210.1
MDRYQKVEKPKVETPIDENEIRITSQGRMRSYITYAMTLLQEKGSDEVVFKAMGRAINKTVTIVELIKRRIVGLHQITAIQSTDITDTWEPLEEGLQILETTRKVSMVTITLSKKDLDMNNVGYQPPIPADQVKVSTELEYDGEGSPIGRGRGRGGRGRGRPRGGPAGNGYAPAEFDDGGYDRNRGYPRGRGRGRGRNFRGRGRGGYYQSDAQNDAGGRGRGGYYQSDAQNDAGGRGRGGYYQSDAQNDAGGRGRGGYYQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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