当前解析结果
SmilChr07G003443| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003443 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003443 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G003443 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 38219806 - 38221743 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130994193 |
|---|---|
| GeneID | 130994193 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994193 |
| 原始查询 | LOC130994193 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994193 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057775209.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057775209.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057775209.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057775209.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057775209.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:38219836 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | A20 |
Chr7:38219836 |
TG |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | A20 |
Chr7:38219843 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr7:38219863 |
GGC |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B31 |
Chr7:38219863 |
GGC |
G |
2bp_deletion | CDS_variant | 1 | B31 |
Chr7:38219934 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B71,B77,C49 |
Chr7:38219939 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B129 |
Chr7:38219945 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B10,B129,C17 |
Chr7:38219948 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B65,C27,D10,D6 |
Chr7:38219972 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B111,B4,B76,D7 |
Chr7:38219979 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B65,C27,D10,D6 |
Chr7:38219988 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B129 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。