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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003444`

染色体: Chr07 坐标: 38225197-38229102 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003444`
名称	SmilChr07G003444
描述	uncharacterized SmilChr07G003444
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	38225197 - 38229102 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994194`
GeneID	`130994194`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994194`
原始查询	`LOC130994194`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0125300; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os08g0125300; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0125300` - identity=31; qcov=0.198; evalue=1.21e-19; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13976 (gag_pre-integrs); PF22936 (Pol_BBD); PF24626 (SH3_Tf2-1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994194

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057775211.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057775211.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775211.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775211.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775211.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:38225221`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,C71
`Chr7:38225232`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B12,B67
`Chr7:38225238`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	65	A15,A18,A2,A7,B103,B107,B108,B110,B122,B124,B128,B13,B137,B139,B140,B19,B20,B24,B33,B37,B38,B39,B46,B49,B60,B61,B69,B70,B76,B77,B78,B81,B84,B9,B93,B94,C1,C15,C18,C20,C21,C23,C25,C26,C31,C4,C44,C47,C48,C49,C51,C58,C6,C60,C61,C62,C65,C70,C71,C75,C76,C78,D1,D3,D7
`Chr7:38225247`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B1,B46,C28,D3
`Chr7:38225247`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B46,C28,D3
`Chr7:38225266`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C30,C65,C77
`Chr7:38225300`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	93	A13,A15,A18,A2,A7,B1,B101,B103,B105,B107,B108,B110,B111,B114,B117,B121,B122,B124,B128,B13,B131,B137,B139,B19,B20,B21,B24,B31,B32,B33,B35,B37,B38,B39,B46,B49,B53,B55,B60,B61,B62,B65,B69,B70,B71,B76,B77,B78,B81,B82,B84,B89,B9,B90,B92,B93,B94,C1,C11,C12,C15,C17,C18,C2,C20,C21,C23,C26,C31,C36,C4,C44,C47,C48,C49,C5,C51,C52,C58,C6,C60,C61,C62,C65,C70,C71,C75,C76,C78,D1,D3,D6,D7
`Chr7:38225302`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	93	A13,A15,A18,A2,A7,B1,B101,B103,B105,B107,B108,B110,B111,B114,B117,B121,B122,B124,B128,B13,B131,B137,B139,B19,B20,B21,B24,B31,B32,B33,B35,B37,B38,B39,B46,B49,B53,B55,B60,B61,B62,B65,B69,B70,B71,B76,B77,B78,B81,B82,B84,B89,B9,B90,B92,B93,B94,C1,C11,C12,C15,C17,C18,C2,C20,C21,C23,C26,C31,C36,C4,C44,C47,C48,C49,C5,C51,C52,C58,C6,C60,C61,C62,C65,C70,C71,C75,C76,C78,D1,D3,D6,D7
`Chr7:38225307`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,D11
`Chr7:38225310`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr7:38225338`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	11	A19,A6,B1,B105,B110,B25,B3,B5,C35,C5,C82
`Chr7:38225346`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	B63,B68,C28,C33,C56,C58,C6,C60,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775211.1

930 aa

465

930

SH3_Tf2-1

Pol_BBD

gag_pre-integrs

PF24626 SH3_Tf2-1 45-92 aa PF22936 Pol_BBD 754-829 aa PF13976 gag_pre-integrs 861-922 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775211.1`	Pfam	`PF24626`	SH3_Tf2-1	Domain	45	92	1.7e-14	54.4	Tf2-1-like, SH3 domain
`XP_057775211.1`	Pfam	`PF22936`	Pol_BBD	Domain	754	829	2.8e-14	53.9	Pol polyprotein, beta-barrel domain
`XP_057775211.1`	Pfam	`PF13976`	gag_pre-integrs	Domain	861	922	1.2e-17	64.2	GAG-pre-integrase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919228.1
ATGGATGGCCAGCGCAGAGCTGAGTTCGTAAGGCAGGTACATGAGAGGGCCAGAGCTAACATCGAGCGCCGCACACGGCAGTATGCAGAGCAGGCTAACCAGGGCCGTCGCAAGGTGGTGTTCGAGCCCGATGATTGGATTTGGCTACACATGCGCAAGGACCGATTTCCAGAGCAGCGGCGTTCTAAGTTACTTCCTAGGAGAGATGGCCCATTTCAAGTGATGGAACGGATCAATGATAATGTCTACAAATTAGACTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994194
ATGGATGGCCAGCGCAGAGCTGAGTTCGTAAGGCAGGTACATGAGAGGGCCAGAGCTAACATCGAGCGCCGCACACGGCAGTATGCAGAGCAGGCTAACCAGGGCCGTCGCAAGGTGGTGTTCGAGCCCGATGATTGGATTTGGCTACACATGCGCAAGGACCGATTTCCAGAGCAGCGGCGTTCTAAGTTACTTCCTAGGAGAGATGGCCCATTTCAAGTGATGGAACGGATCAATGATAATGTCTACAAATTAGACTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775211.1
MDGQRRAEFVRQVHERARANIERRTRQYAEQANQGRRKVVFEPDDWIWLHMRKDRFPEQRRSKLLPRRDGPFQVMERINDNVYKLDLPAQSRASDTAQSRALNAVQSRDPVHVPIGPVTRARSKTFKANLMALVEEIWKQELRKPIGDRLPEQSTSVVNLVTYRADVQSRAEQIRRTEQSKPAEQSRRAGLPCVFSVQSGEDLVITGEDHIMSARPPTLDSGGKNYNLWKTRMKIYVKSIDERAWVAVLDGWTPPNTTDD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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