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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003452`

染色体: Chr07 坐标: 38550287-38551261 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003452`
名称	SmilChr07G003452
描述	uncharacterized SmilChr07G003452
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	38550287 - 38551261 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994196`
GeneID	`130994196`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994196`
原始查询	`LOC130994196`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PIF1 helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824333]; symbol=AT3G51700; hit=AT3G51700; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	PIF1 helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824333]; symbol=AT3G51700; hit=AT3G51700; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G51700` (AT3G51700) PIF1 helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824333] identity=41; qcov=0.806; evalue=2.12e-59; confidence=medium
Rice	`Os07g0255200` - identity=33.8; qcov=0.676; evalue=1.18e-37; confidence=low
GO	GO:0000723 (telomere maintenance); GO:0003678 (DNA helicase activity); GO:0006281 (DNA repair)
KEGG	-
Pfam	PF05970 (PIF1); PF21530 (Pif1_2B_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994196

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775213.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057775213.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775213.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775213.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775213.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:38550295`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	65	A1,A11,A19,A3,A9,B10,B102,B104,B105,B108,B109,B110,B111,B112,B113,B117,B118,B131,B137,B22,B27,B28,B40,B42,B43,B47,B5,B50,B51,B52,B59,B60,B76,B77,B80,B86,B89,B97,B98,C1,C14,C15,C30,C43,C44,C45,C46,C48,C54,C55,C56,C57,C59,C6,C61,C65,C73,C81,C82,C86,D1,D10,D11,D3,D8
`Chr7:38550328`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D10
`Chr7:38550328`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:38550334`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr7:38550362`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B71
`Chr7:38550362`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B71
`Chr7:38550370`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,B31,C80
`Chr7:38550400`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	A1,A3,B74,C5
`Chr7:38550400`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	CDS_variant	4	A1,A3,B74,C5
`Chr7:38550408`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,C58,D5,D6
`Chr7:38550471`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B69,C78
`Chr7:38550474`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	A20,B69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775213.1

324 aa

162

324

PIF1

Pif1_2B_dom

PF05970 PIF1 8-94 aa PF21530 Pif1_2B_dom 190-236 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775213.1`	Pfam	`PF05970`	PIF1	Family	8	94	3.9e-27	96.0	PIF1-like helicase
`XP_057775213.1`	Pfam	`PF21530`	Pif1_2B_dom	Domain	190	236	3.9e-18	65.6	DNA helicase Pif1, 2B domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919230.1
ATGCGGTTTGTCAATCCATCAAGTGCATCCACCCTTTTTGGAGGCAAGACAGTCTTTGGAGGTGATCTCAGACAGATATTGCCTGTTATTCCAAAAGAAAGTAGACAAGATATTATTTTTGCAACAATAAATTCTTCATATCTTTGGAGATATTGTAAAGTTTTACGGTTGACAAAAAATATGAGGCTTCAAAATATGGGTTCCAGTGTTGAAGCTATGGAGTTGGAAGAGTTCTCTAAATGGATTGCGAGCATAGGCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994196
ATGCGGTTTGTCAATCCATCAAGTGCATCCACCCTTTTTGGAGGCAAGACAGTCTTTGGAGGTGATCTCAGACAGATATTGCCTGTTATTCCAAAAGAAAGTAGACAAGATATTATTTTTGCAACAATAAATTCTTCATATCTTTGGAGATATTGTAAAGTTTTACGGTTGACAAAAAATATGAGGCTTCAAAATATGGGTTCCAGTGTTGAAGCTATGGAGTTGGAAGAGTTCTCTAAATGGATTGCGAGCATAGGCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775213.1
MRFVNPSSASTLFGGKTVFGGDLRQILPVIPKESRQDIIFATINSSYLWRYCKVLRLTKNMRLQNMGSSVEAMELEEFSKWIASIGDGTIGSANDGHVNIDIPPDLFIKWSGDPIKHIVNTIYPSYCADNVDTSYLQERAILAPTINAVESVNQYMISLNKTEGQLYRSSDSTSRSDSVTNLVQQVHTPEFLNGIKYSRVPNHELYLKVGTPVMLLRNIDHANELCNDTRLMITRLGYHVLEAQILTGDNAGQKNLIPRM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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