当前解析结果
SmilChr07G003500| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003500 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003500 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G003500 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 39864888 - 39866352 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130994209 |
|---|---|
| GeneID | 130994209 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994209 |
| 原始查询 | LOC130994209 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994209 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057775227.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057775227.1 |
| 3 | Cytoplasmic granule | 细胞质颗粒 | 0.60000 | XP_057775227.1 |
| 4 | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | 0.60000 | XP_057775227.1 |
| 5 | P-body | P-body | 0.20000 | XP_057775227.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:39864890 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B71,B92,C27,D4 |
Chr7:39864903 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C65 |
Chr7:39864908 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B56,B96 |
Chr7:39864926 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D3 |
Chr7:39864946 |
AG |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | C14,D8 |
Chr7:39864946 |
AG |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 2 | C14,D8 |
Chr7:39864948 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B46,B60 |
Chr7:39864955 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B39,B91,C39,D6,D7 |
Chr7:39864965 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A9,B66 |
Chr7:39864975 |
G |
GC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 8 | A10,B100,B104,B31,B48,B99,C26,D5 |
Chr7:39864991 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B112 |
Chr7:39864998 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 12 | A13,B13,B46,B71,B82,B90,B92,C31,C47,C61,C62,C75 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。