当前解析结果
SmilChr07G003510| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003510 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003510 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G003510 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 40014531 - 40016286 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130994216 |
|---|---|
| GeneID | 130994216 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994216 |
| 原始查询 | LOC130994216 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994216 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057775234.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057775234.1 |
| 3 | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | 0.20000 | XP_057775234.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057775234.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057775234.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:40014537 |
ATG |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 10 | B140,B23,B35,C10,C14,C18,C3,C63,C70,D8 |
Chr7:40014540 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B140,C14,C63,D8 |
Chr7:40014541 |
A |
ATG |
2bp_insertion | frameshift_variant | 7 | A7,B112,B118,B119,B18,B24,B62 |
Chr7:40014642 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 45 | A15,A21,A23,A7,B104,B105,B107,B108,B109,B112,B114,B118,B119,B120,B125,B136,B137,B16,B17,B18,B20,B24,B25,B34,B52,B56,B58,B62,B69,B75,B85,B86,B93,C21,C24,C27,C30,C33,C54,C55,C6,C7,C71,C86,C87 |
Chr7:40014643 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 97 | A1,A14,A15,A19,A25,A4,A5,A6,A8,B1,B101,B105,B109,B111,B113,B123,B128,B129,B13,B131,B135,B136,B138,B140,B15,B19,B24,B29,B3,B31,B32,B33,B38,B39,B4,B44,B45,B46,B47,B49,B51,B52,B53,B54,B55,B59,B6,B62,B63,B68,B7,B70,B72,B76,B79,B81,B84,B87,B88,B9,B91,B98,B99,C12,C13,C15,C19,C22,C25,C26,C28,C29,C31,C36,C40,C42,C45,C47,C49,C53,C55,C58,C64,C65,C66,C71,C74,C77,C8,C80,C84,C85,D11,D4,D5,D6,D7 |
Chr7:40014686 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr7:40014697 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B13,B61,C5,C71 |
Chr7:40014729 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C50,C57 |
Chr7:40014737 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 70 | A15,A21,A23,A25,A3,A7,A8,B1,B104,B105,B107,B108,B109,B11,B114,B118,B119,B124,B125,B131,B136,B137,B14,B15,B16,B17,B18,B19,B20,B22,B23,B24,B25,B26,B3,B32,B34,B37,B52,B56,B58,B62,B73,B85,B86,B94,B95,B96,C10,C13,C14,C15,C21,C24,C25,C26,C27,C3,C30,C43,C50,C54,C55,C6,C60,C7,C71,C77,C86,C87 |
Chr7:40014742 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 4 | B13,B61,C5,C71 |
Chr7:40014742 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B13,B61,C5,C71 |
Chr7:40014766 |
A |
AT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 101 | A1,A14,A15,A18,A19,A25,A4,A5,A6,A8,B1,B101,B105,B109,B111,B113,B115,B123,B128,B129,B13,B131,B135,B136,B138,B14,B140,B15,B19,B24,B29,B3,B31,B32,B33,B38,B39,B4,B44,B45,B46,B47,B49,B51,B52,B53,B54,B55,B59,B6,B62,B63,B68,B7,B70,B72,B76,B79,B81,B84,B87,B88,B9,B91,B98,B99,C12,C13,C15,C19,C22,C25,C26,C28,C29,C31,C36,C40,C42,C45,C46,C47,C49,C53,C55,C58,C61,C64,C66,C71,C74,C77,C8,C80,C84,C85,D11,D4,D5,D6,D7 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。