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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003520`

染色体: Chr07 坐标: 40328032-40329474 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003520`
名称	SmilChr07G003520
描述	uncharacterized SmilChr07G003520
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	40328032 - 40329474 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994218`
GeneID	`130994218`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994218`
原始查询	`LOC130994218`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0484800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G43760` (AT1G43760) DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968] identity=25.6; qcov=0.79; evalue=2.32e-25; confidence=low
Rice	`Os06g0484800` - identity=26.2; qcov=0.762; evalue=1.17e-29; confidence=low
GO	GO:0003824 (catalytic activity)
KEGG	-
Pfam	PF03372 (Exo_endo_phos)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994218

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057775236.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057775236.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057775236.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775236.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775236.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:40328047`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B28,B65,C12
`Chr7:40328065`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	12	A13,A22,A8,B107,B120,B67,C29,C31,C44,C47,C74,D1
`Chr7:40328068`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	13	A13,A22,A8,B107,B120,B67,C29,C31,C44,C47,C74,D1,D8
`Chr7:40328083`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	A8,B107,B67,C29,C31,C44,C47,C74,D1
`Chr7:40328088`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	A8,B67,C29,C31,C44,C47,C74,D1
`Chr7:40328089`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	24	A20,A3,A4,B106,B11,B112,B114,B132,B17,B37,B51,B52,B64,B73,B74,B75,C21,C30,C54,C64,C65,C72,C81,D11
`Chr7:40328090`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	A4,B106,B52,B64,B73,D11
`Chr7:40328099`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B2,B68,B93,C82,D9
`Chr7:40328104`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr7:40328115`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C29,D1
`Chr7:40328123`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr7:40328156`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	B3,B42,B47,B56,B59,B96,B97

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775236.1

480 aa

240

480

Exo_endo_phos

PF03372 Exo_endo_phos 4-227 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775236.1`	Pfam	`PF03372`	Exo_endo_phos	Domain	4	227	1.5e-10	41.9	Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919253.1
ATGAATTTTATCTCCTACAACATCAGAGGTCTGGGGAGTGTCGCAAAACAAAGAGACGTCGGAGAAATCATCAAAAAACACAAAGCAGAGCTGTGCTTCATTCAGGAAACGAAATTGGAGAAGTTCCCAGATTTTGTGTGCAGGGCTTGGTGGGGGACGAATAATTTCGATTTGGCAGTCAGAAACTCAGAAGGAAGGTCTGGAGGCATTGCCAGCATTTGGAATACCGACGTGTTTGCGGCTTCAAGCAAATGGGATCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994218
ATGAATTTTATCTCCTACAACATCAGAGGTCTGGGGAGTGTCGCAAAACAAAGAGACGTCGGAGAAATCATCAAAAAACACAAAGCAGAGCTGTGCTTCATTCAGGAAACGAAATTGGAGAAGTTCCCAGATTTTGTGTGCAGGGCTTGGTGGGGGACGAATAATTTCGATTTGGCAGTCAGAAACTCAGAAGGAAGGTCTGGAGGCATTGCCAGCATTTGGAATACCGACGTGTTTGCGGCTTCAAGCAAATGGGATCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775236.1
MNFISYNIRGLGSVAKQRDVGEIIKKHKAELCFIQETKLEKFPDFVCRAWWGTNNFDLAVRNSEGRSGGIASIWNTDVFAASSKWDLPGVVVVNGLWKNGNISCCFINVYAPSSCSEKLRLWDAIGNIVNLHADCCVCVLGDFNAVRRQDERVGCGEFSGATDAKRFDAFIRESGLTEIRVQGRKFTWCKPNGKCKSKLDRFLVNETWMRVWPESNGRGIQRSISDHCPIFLTTKTEDWGPKPFRFINAWVSHPGFKQVV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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