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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003565`

染色体: Chr07 坐标: 41652867-41655219 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003565`
名称	SmilChr07G003565
描述	uncharacterized SmilChr07G003565
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	41652867 - 41655219 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994228`
GeneID	`130994228`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994228`
原始查询	`LOC130994228`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0256400; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os11g0256400; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=27.9; qcov=0.953; evalue=1.28e-19; confidence=low
Rice	`Os11g0256400` - identity=39.1; qcov=0.92; evalue=4.08e-59; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994228

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057775249.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057775249.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775249.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775249.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775249.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:41654390`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B75,B79
`Chr7:41654393`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr7:41654412`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B72
`Chr7:41654412`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr7:41654419`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B111,B20
`Chr7:41654419`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,B20
`Chr7:41654470`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A8,B105,B48
`Chr7:41654470`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B105,B48
`Chr7:41654648`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B98,C87
`Chr7:41654653`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B122,B55,C56
`Chr7:41654662`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B122,B55,C56
`Chr7:41654664`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B10,B24,B26,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775249.1

275 aa

138

275

MULE

Transposase_mut

PF10551 MULE 17-113 aa PF00872 Transposase_mut 39-147 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775249.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	17	113	8e-15	55.7	MULE transposase domain
`XP_057775249.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	39	147	4.3e-05	23.3	Transposase, Mutator family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919266.1
CACACCTATGCGTCTGATTATGAAAATGAAACCCATGAATTTGTGTCTGAGGAGAGTGATTCTGATTTTGAACCACGATTGAGAAAAAAAAGACTCGTGTATGATCCGAAGTGTGACCATAGAAAACTTGAAATTGTCATAGGAATGCACTTTCAGGATGGTTTTCAGTGTAGAGAGGCTTTAACCACTTGGGCAATTGAAAATGGTAGGTACATTCGGTTTAGGGTTGTTTCTAAGAAGAAACTTTTAGCAAAGTGTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994228
ATGGGTTTGAGTGCCTTGAGAAAAGGATTCAAGAAGAGTTGCCGGCCTGTCATAGGCATAGATGGATGTTTTTTGAAAACATACCTCGGCAGTCATCTCCTTTGTGCAACAGGCAAGGATGGAAACAATGGTATGTTTCCAATTGCCTGGGCCGTAGTTGAGGCTGAGAATGAAGTTTGCTGGACTTGGTTTTTGAAGTGTCTTCTTGAGGATTTAGATATTGGAGATGGCAGTGGGTGGACCTTCATTAGTGATCAACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775249.1
MGLSALRKGFKKSCRPVIGIDGCFLKTYLGSHLLCATGKDGNNGMFPIAWAVVEAENEVCWTWFLKCLLEDLDIGDGSGWTFISDQQKGLANAVAALALKAEHRNCARHVYMNWKKEHKGQTLKNLFFRAVYATHEAEFKVAVLELKQESATAHEDFISRDIKKFCKAFISSQPKSDSFDNNISECFNGYILNARGKHVIHMLEKIRSSLMVRQVQKFKAMSSVTNKLTPNVSKLLERNVMASAYCMALPAMHDTFQVHY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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