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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003569`

染色体: Chr07 坐标: 41667665-41668519 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003569`
名称	SmilChr07G003569
描述	uncharacterized SmilChr07G003569
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	41667665 - 41668519 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994229`
GeneID	`130994229`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994229`
原始查询	`LOC130994229`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814982]; symbol=AT2G04420; hit=AT2G04420; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814982]; symbol=AT2G04420; hit=AT2G04420; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G04420` (AT2G04420) Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814982] identity=28.6; qcov=0.75; evalue=8.02e-14; confidence=low
Rice	`Os06g0683500` - identity=30.1; qcov=0.479; evalue=2.18e-11; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994229

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057775250.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057775250.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057775250.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057775250.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775250.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:41667716`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr7:41667758`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B102,B139,B50,B53,B66
`Chr7:41667763`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B139,B50,B66
`Chr7:41667783`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B88,C20,C77
`Chr7:41667794`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B50,B66
`Chr7:41667803`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr7:41667824`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr7:41667831`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B50,B53,B66
`Chr7:41667841`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A7
`Chr7:41667841`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A7
`Chr7:41667844`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	A7
`Chr7:41667844`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	A7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775250.1

284 aa

142

284

RVT_3

PF13456 RVT_3 132-251 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775250.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	132	251	7.1e-17	62.2	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919267.1
ATGTGGTGCGCGTTGTTGAATTGGTTTGGTTTGGATGAGGGATTGTCTTGCTACGGTATTCATGAGCTGTTAGTGTTTGCATGGACGTTACAGCTGAGCTCACAAATCAAAAAGTTCTGGAAGTTGGGAGTTATTTCTTTAATCTGGGCTCTTTGGACAGCAAGAAATAAGTGTCATTTTGATGACAAAACTTTTATTCATCAAGAGATCCTGGTTTTCCTTAAAGCTACTTTTATTGAAGTAGACAATTCGTTTCCAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994229
ATGTGGTGCGCGTTGTTGAATTGGTTTGGTTTGGATGAGGGATTGTCTTGCTACGGTATTCATGAGCTGTTAGTGTTTGCATGGACGTTACAGCTGAGCTCACAAATCAAAAAGTTCTGGAAGTTGGGAGTTATTTCTTTAATCTGGGCTCTTTGGACAGCAAGAAATAAGTGTCATTTTGATGACAAAACTTTTATTCATCAAGAGATCCTGGTTTTCCTTAAAGCTACTTTTATTGAAGTAGACAATTCGTTTCCAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775250.1
MWCALLNWFGLDEGLSCYGIHELLVFAWTLQLSSQIKKFWKLGVISLIWALWTARNKCHFDDKTFIHQEILVFLKATFIEVDNSFPKMGHMDNKWKDYLVIWQMGVRPRVRPPPEMTSVYWSPPAYLWLKANSDGSAMEAPGRIYAGGVFRDWRGFVRGCFHVEGGLGFAFEAELLRVISAIQLAHRWGWNKLWFEADSSYVVHILSTKSTRVPWRFKAIWNQALLLLERIDYRISHIFREGNVPADIMASPHTPEGWWP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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