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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003594`

染色体: Chr07 坐标: 42020057-42020585 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003594`
名称	SmilChr07G003594
描述	uncharacterized SmilChr07G003594
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	42020057 - 42020585 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994236`
GeneID	`130994236`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994236`
原始查询	`LOC130994236`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os09g0268600; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os09g0268600; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os09g0268600` - identity=26.9; qcov=0.73; evalue=6.99e-07; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994236

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775257.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057775257.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775257.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775257.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775257.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:42020078`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B117,B85,C76
`Chr7:42020078`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B85,C76
`Chr7:42020081`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	171	A1,A10,A13,A14,A16,A18,A19,A20,A21,A22,A3,A6,A9,B10,B100,B101,B102,B104,B105,B107,B108,B110,B111,B112,B114,B115,B117,B118,B119,B12,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B13,B130,B134,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B18,B19,B2,B21,B23,B25,B26,B3,B30,B32,B35,B36,B37,B4,B40,B41,B44,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B55,B56,B57,B58,B61,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B7,B70,B74,B75,B77,B78,B79,B8,B81,B82,B83,B85,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B96,B99,C10,C11,C12,C13,C14,C17,C18,C2,C20,C21,C23,C24,C25,C26,C27,C3,C32,C33,C36,C38,C4,C41,C42,C43,C46,C47,C48,C5,C50,C51,C52,C54,C59,C60,C62,C63,C64,C65,C66,C68,C69,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C77,C78,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C86,C87,C9,D11,D2,D3,D4,D6,D7,D8
`Chr7:42020108`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr7:42020118`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C76
`Chr7:42020118`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C76
`Chr7:42020185`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr7:42020250`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B44,C35,C60,C75
`Chr7:42020261`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B44,C35,C52,C60
`Chr7:42020261`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B44,C35,C52,C60
`Chr7:42020275`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B44,C35,C52,C60
`Chr7:42020302`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775257.1

148 aa

148

SWIM

PF04434 SWIM 58-86 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775257.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	58	86	1e-06	28.9	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919274.1
ATGGAGAAACGGTTTGATACACGACGAGCAGAAGTTGCATCTAGGTCACATGAGTTGATTGAGCAGGTGGCATCAAAGTTGCAAGTGGCTATTGAAGTGGGTCGACAATTGCTTGTTCGAGGGACGACGACACATATGTTTAGTGTTGAAGATGATCATGCATTCTGCATTGTTGATCTTGAAAATCGAACTTGTGATTGTGCTCAGTTCGATCTGGACGAGATTCTATGTCGTCATGCATGTGCCGTTATTAGGCGTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994236
ATGGAGAAACGGTTTGATACACGACGAGCAGAAGTTGCATCTAGGTCACATGAGTTGATTGAGCAGGTGGCATCAAAGTTGCAAGTGGCTATTGAAGTGGGTCGACAATTGCTTGTTCGAGGGACGACGACACATATGTTTAGTGTTGAAGATGATCATGCATTCTGCATTGTTGATCTTGAAAATCGAACTTGTGATTGTGCTCAGTTCGATCTGGACGAGATTCTATGTCGTCATGCATGTGCCGTTATTAGGCGTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775257.1
MEKRFDTRRAEVASRSHELIEQVASKLQVAIEVGRQLLVRGTTTHMFSVEDDHAFCIVDLENRTCDCAQFDLDEILCRHACAVIRRAGLQVTDFEGKYFKQPILLATYMPPIVSVPHPMYWNVPDEISAYVVTAPNITRHTIPISYKL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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