当前解析结果
SmilChr07G003596| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003596 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003596 |
| 描述 | BRI1 kinase inhibitor 1-like |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 42048984 - 42054248 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130994237 |
|---|---|
| GeneID | 130994237 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994237 |
| 原始查询 | LOC130994237 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | BRI1 kinase inhibitor 1-like |
| 产物 | BRI1 kinase inhibitor 1-like |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | GO:0005886 (plasma membrane); GO:0019210 (kinase inhibitor activity) |
| KEGG | smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)) |
| Pfam | PF30743 (BKI1) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994237 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057775258.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057775258.1 |
| 3 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.40000 | XP_057775258.1 |
| 4 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057775258.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057775258.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:42049024 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 41 | A15,A18,A20,A23,A25,B1,B103,B104,B114,B119,B120,B125,B126,B131,B136,B139,B140,B17,B18,B33,B34,B35,B41,B48,B73,B78,B80,B86,B93,C1,C24,C28,C31,C35,C40,C65,C7,C82,C83,D11,D2 |
Chr7:42049031 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B140,B2,B93 |
Chr7:42049063 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B124,C16 |
Chr7:42053797 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B106 |
Chr7:42053837 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B129,C14,C5,D10 |
Chr7:42053840 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B50,B57 |
Chr7:42053853 |
C |
CT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 8 | B107,B29,B34,B35,B65,C34,C63,C71 |
Chr7:42053855 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B56,B96 |
Chr7:42053878 |
T |
TCA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 10 | B107,B29,B34,B35,B56,B65,B96,C34,C63,C71 |
Chr7:42053908 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A18 |
Chr7:42053925 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B104,B114,B140,B55,C63 |
Chr7:42053932 |
T |
TA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | A22 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057775258.1PF30743
BKI1 51-191 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057775258.1 |
Pfam | PF30743 |
BKI1 | Family | 51 | 191 | 2.4e-38 | 133.0 | BRI1 kinase inhibitor 1 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。