当前解析结果
SmilChr07G003724| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003724 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003724 |
| 描述 | protein GRIP-like |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 45227140 - 45229439 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130994275 |
|---|---|
| GeneID | 130994275 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994275 |
| 原始查询 | LOC130994275 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein GRIP-like |
| 产物 | protein GRIP-like |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994275 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057775302.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057775302.1 |
| 3 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.20000 | XP_057775302.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057775302.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057775302.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:45227152 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C60 |
Chr7:45228764 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B75,C24,C9,D8 |
Chr7:45228773 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B108,B119,B122,B81,C57 |
Chr7:45228798 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B75,B90,C24,C9,D8 |
Chr7:45228811 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A2,A21,B20 |
Chr7:45228840 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B101,B131 |
Chr7:45228845 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B90,C9,D8 |
Chr7:45228876 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C37 |
Chr7:45228896 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B140,B33,D10 |
Chr7:45228909 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr7:45229099 |
T |
TC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 3 | B10,C35,C69 |
Chr7:45229099 |
T |
TC |
1bp_insertion | CDS_variant | 3 | B10,C35,C69 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。