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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003788`

染色体: Chr07 坐标: 46540119-46540709 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003788`
名称	SmilChr07G003788
描述	uncharacterized SmilChr07G003788
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	46540119 - 46540709 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994291`
GeneID	`130994291`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994291`
原始查询	`LOC130994291`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc knuckle (CCHC-type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827935]; symbol=AT4G00980; hit=AT4G00980; species=arabidopsis; confidence=low
产物	zinc knuckle (CCHC-type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827935]; symbol=AT4G00980; hit=AT4G00980; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G00980` (AT4G00980) zinc knuckle (CCHC-type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827935] identity=32.4; qcov=0.724; evalue=1.31e-21; confidence=low
Rice	`Os08g0421300` - identity=26.1; qcov=0.724; evalue=7.18e-10; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14223 (Retrotran_gag_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994291

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057775321.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057775321.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057775321.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775321.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775321.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:46540121`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr7:46540135`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr7:46540140`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B125
`Chr7:46540150`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr7:46540151`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B99,D11
`Chr7:46540160`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr7:46540193`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr7:46540205`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr7:46540219`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr7:46540226`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,C35
`Chr7:46540231`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	C35,C58,C78
`Chr7:46540231`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C35,C58,C78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775321.1

196 aa

196

Retrotran_gag_2

PF14223 Retrotran_gag_2 1-176 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775321.1`	Pfam	`PF14223`	Retrotran_gag_2	Domain	1	176	8.4e-25	88.2	gag-polypeptide of LTR copia-type

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919338.1
ATGCTATTCTACCTCACAACCGTGGGGTTTGCCGGGTTCTTGATGGATGATAGGCCTCCAACCCCGAGTGAAGGGGAGATGAGCTTCGAAGTTCGTGCCGGGTATGCGAATTGGTGTCAAGGCGACTACTTGTGCCGCAACACCATTCTTATGTCCTTGGACGAGCGGCTCTACAACGTCTTCAAGGTCCATAAGACCTCGAAAGAGGTGTGGGAGACACTTGATCTCAAATATCAAGTGGACAAGACGAATACTACAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994291
ATGCTATTCTACCTCACAACCGTGGGGTTTGCCGGGTTCTTGATGGATGATAGGCCTCCAACCCCGAGTGAAGGGGAGATGAGCTTCGAAGTTCGTGCCGGGTATGCGAATTGGTGTCAAGGCGACTACTTGTGCCGCAACACCATTCTTATGTCCTTGGACGAGCGGCTCTACAACGTCTTCAAGGTCCATAAGACCTCGAAAGAGGTGTGGGAGACACTTGATCTCAAATATCAAGTGGACAAGACGAATACTACAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775321.1
MLFYLTTVGFAGFLMDDRPPTPSEGEMSFEVRAGYANWCQGDYLCRNTILMSLDERLYNVFKVHKTSKEVWETLDLKYQVDKTNTTKYVVAKWLDYKMVDSRPVMDQVEEFQTLSHEVQAEGMPLADALLVAIIIEKLPPSWKSFQNLLKHERSEMSVATLVSKLQMEDHVRSRDQKGKAPMDAKANLTEKGGPSN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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