当前解析结果
SmilChr07G003806| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003806 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003806 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G003806 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 46906777 - 46909738 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130994297 |
|---|---|
| GeneID | 130994297 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994297 |
| 原始查询 | LOC130994297 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak |
| 产物 | hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os12g0292200- identity=41.9; qcov=0.262; evalue=2.95e-06; confidence=weak |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994297 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057775327.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057775327.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057775327.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057775327.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057775327.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:46906784 |
G |
GA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | B53 |
Chr7:46906784 |
G |
GA |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | B53 |
Chr7:46909303 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B128,C55 |
Chr7:46909303 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B128,C55 |
Chr7:46909334 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D6 |
Chr7:46909349 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B128,C55,C58 |
Chr7:46909391 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B140,B16,C74,C81 |
Chr7:46909396 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B37,B56,B61,B80 |
Chr7:46909409 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B6 |
Chr7:46909412 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B120,D11 |
Chr7:46909421 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B66 |
Chr7:46909422 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B128,C69 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。