当前解析结果
SmilChr07G003827| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003827 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003827 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G003827 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 47322172 - 47325518 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130994305 |
|---|---|
| GeneID | 130994305 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994305 |
| 原始查询 | LOC130994305 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os03g0643433- identity=36.2; qcov=0.376; evalue=3.07e-06; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994305 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057775334.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057775334.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057775334.1 |
| 4 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.20000 | XP_057775334.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057775334.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:47322208 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A10,B135,B6,C44 |
Chr7:47322246 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr7:47322258 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B134,D9 |
Chr7:47322307 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr7:47322320 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C41 |
Chr7:47322322 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr7:47324489 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C32,D11 |
Chr7:47324494 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C33 |
Chr7:47324496 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B26 |
Chr7:47324503 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C33 |
Chr7:47324508 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A14,B117,B138,C27,C70 |
Chr7:47324513 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B45,C19 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。