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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003871`

染色体: Chr07 坐标: 48191268-48192629 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003871`
名称	SmilChr07G003871
描述	uncharacterized SmilChr07G003871
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	48191268 - 48192629 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994313`
GeneID	`130994313`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994313`
原始查询	`LOC130994313`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os03g0439900` - identity=28.7; qcov=0.4; evalue=2.03e-17; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03732 (PEG10_N-capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994313

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057775342.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057775342.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057775342.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775342.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775342.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:48191271`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr7:48191278`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	A20,B98,C3,C86
`Chr7:48191278`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	4	A20,B98,C3,C86
`Chr7:48191281`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	A20,B98,C3,C86
`Chr7:48191281`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	CDS_variant	4	A20,B98,C3,C86
`Chr7:48191292`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B37,B75,C32,C68,C75
`Chr7:48191313`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B35
`Chr7:48191331`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,C3,C86
`Chr7:48191349`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	A3,A5,A9,B100,B25,B29,C41,C43,C87,D6
`Chr7:48191353`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B49,C17,C49,C61,C78
`Chr7:48191360`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr7:48191361`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	A23,B55,C34,C36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775342.1

453 aa

226

453

PEG10_N-capsid

PF03732 PEG10_N-capsid 10-83 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775342.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	10	83	7.9e-10	39.7	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919359.1
ATGCCCAAGAAGTTCAGTTTTCCACACATGAAGATGTTTGACGGCGCATCCGATCCAGACGACCATATAGCTCAGTACCGTCAAAGAATGTTCACCATTGCTATTCCTCGTGACATGAGGGAGGTGTGCATGTTTAAGGGGTTCGGTTCTAGCCTAATAGGATCAGCCCTCCAGTGGTATACGAATCTTCCTAATAATTCAATTAGTTCTTTTGCTCAACTAACGGATGTTTTTGTTCAACAGTATGTAAACAACAGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994313
ATGCCCAAGAAGTTCAGTTTTCCACACATGAAGATGTTTGACGGCGCATCCGATCCAGACGACCATATAGCTCAGTACCGTCAAAGAATGTTCACCATTGCTATTCCTCGTGACATGAGGGAGGTGTGCATGTTTAAGGGGTTCGGTTCTAGCCTAATAGGATCAGCCCTCCAGTGGTATACGAATCTTCCTAATAATTCAATTAGTTCTTTTGCTCAACTAACGGATGTTTTTGTTCAACAGTATGTAAACAACAGAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775342.1
MPKKFSFPHMKMFDGASDPDDHIAQYRQRMFTIAIPRDMREVCMFKGFGSSLIGSALQWYTNLPNNSISSFAQLTDVFVQQYVNNRKLEKISEDLYAIVQRHGEPLWDYIGRFNKEKVSITNCSEQTAVTAFRKGLLPGSDLYKTLTKYPCKTMEDVLIQAWAQIKWEEDQYNMQRIFLLERPERDYRVDRRSGRDSRDRRTEPYTPSQRGNKGRRDYDQAPSTGPRERTKLPEYLLSISPVEAVTTLMNLGDKVRWPEK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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