当前解析结果
SmilChr07G003877| 统一新 Gene ID | SmilChr07G003877 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003877 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G003877 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 48363265 - 48363826 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130994317 |
|---|---|
| GeneID | 130994317 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994317 |
| 原始查询 | LOC130994317 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994317 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057775346.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057775346.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057775346.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057775346.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057775346.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:48363325 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C68,C82 |
Chr7:48363332 |
AG |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 6 | B1,B129,B29,B3,B91,B94 |
Chr7:48363379 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B126 |
Chr7:48363416 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B94 |
Chr7:48363417 |
G |
GT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 30 | A16,A20,A5,B123,B131,B31,B34,B43,B50,B53,B71,B78,B82,B86,C10,C11,C23,C28,C3,C45,C49,C58,C65,C70,C71,C77,C80,C81,C87,D8 |
Chr7:48363438 |
TA |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | A9 |
Chr7:48363438 |
TA |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | A9 |
Chr7:48363516 |
A |
AG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | B94 |
Chr7:48363516 |
A |
AG |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | B94 |
Chr7:48363541 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B107,B20,B98 |
Chr7:48363571 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B53,C73 |
Chr7:48363597 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A3,B106,B63,C10,D5 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。