当前解析结果
SmilChr01G003569| 统一新 Gene ID | SmilChr01G003569 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G003569 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G003569 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 54255327 - 54257469 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130994322 |
|---|---|
| GeneID | 130994322 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994322 |
| 原始查询 | LOC130994322 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830861]; symbol=AT5G09995; hit=AT5G09995; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830861]; symbol=AT5G09995; hit=AT5G09995; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT5G09995 (AT5G09995)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830861] identity=60; qcov=0.885; evalue=6.21e-64; confidence=high |
| Rice | Os06g0225400 (P0690H04.6-1)- identity=45.1; qcov=0.531; evalue=1.02e-20; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994322 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057775352.1 |
| 2 | Chloroplast membrane | 叶绿体膜 | 1.00000 | XP_057775352.1 |
| 3 | Chloroplast thylakoid | 类囊体 | 0.60000 | XP_057775357.1 |
| 4 | Chloroplast thylakoid membrane | 类囊体膜 | 0.20000 | XP_057775357.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057775352.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:54255794 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B129 |
Chr1:54255883 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A9 |
Chr1:54257183 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C60 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。