当前解析结果
SmilChr07G003913| 统一基因 ID | SmilChr07G003913 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G003913 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G003913 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 49362892 - 49365825 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130994326 |
|---|---|
| GeneID | 130994326 |
| locus_tag | - |
| NCBI 名称 | LOC130994326 |
| 原始查询 | LOC130994326 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| 拟南芥 | -- |
| 水稻 | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994326 |
预测得分表示模型支持程度,不能作为定位概率;所有候选均需实验验证。
当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定;当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选,预测得分表示模型支持程度,不是校准概率,也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签,应谨慎解读其在植物中的适用性。 四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核,原始投票全部一致。
| 排序 | 定位位置 | 预测得分 | 蛋白 ID |
|---|---|---|---|
| 1 | 细胞核 | 1.00000 | XP_057775356.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | 参考等位基因 | 变异等位基因 | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:49362996 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B100,B66,B97 |
Chr7:49363043 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B25,C84 |
Chr7:49363044 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B117 |
Chr7:49363061 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr7:49363248 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 31 | A18,A19,A9,B104,B105,B106,B110,B113,B134,B137,B19,B23,B29,B35,B41,B50,B51,B71,B9,B91,B95,B99,C55,C68,C74,C78,C85,D3,D6,D7,D9 |
Chr7:49363299 |
T |
TGG |
2bp_insertion | frameshift_variant | 1 | B110 |
Chr7:49363299 |
T |
TGG |
2bp_insertion | CDS_variant | 1 | B110 |
Chr7:49363330 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr7:49363334 |
C |
CA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | B92 |
Chr7:49363334 |
C |
CA |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | B92 |
Chr7:49363335 |
A |
AAT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 1 | B125 |
Chr7:49363335 |
A |
AAT |
2bp_insertion | CDS_variant | 1 | B125 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。