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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003923`

染色体: Chr07 坐标: 49543732-49545927 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003923`
名称	SmilChr07G003923
描述	subtilisin-like protease
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	49543732 - 49545927 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994329`
GeneID	`130994329`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994329`
原始查询	`LOC130994329`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	subtilisin-like protease
产物	subtilisin-like protease
Arabidopsis	`AT1G04110` (SDD1) Subtilase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839287] identity=45.4; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0524600` (OsSub61) - identity=50.4; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004252 (serine-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00082 (Peptidase_S8); PF02225 (PA); PF05922 (Inhibitor_I9); PF17766 (fn3_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994329

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057775360.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057775360.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057775360.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775360.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775360.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:49543933`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B90,B92,C21
`Chr7:49543974`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr7:49544037`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr7:49544063`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A3,A9,C4
`Chr7:49544063`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A3,A9,C4
`Chr7:49544148`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14
`Chr7:49544262`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,B51
`Chr7:49544272`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B117
`Chr7:49544272`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B117
`Chr7:49544337`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B94,C80
`Chr7:49544387`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr7:49544401`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775360.1

731 aa

366

731

Inhibitor_I9

Peptidase_S8

fn3_6

PF05922 Inhibitor_I9 32-104 aa PF00082 Peptidase_S8 127-553 aa PF02225 PA 349-435 aa PF17766 fn3_6 631-728 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775360.1`	Pfam	`PF05922`	Inhibitor_I9	Domain	32	104	1.4e-09	39.2	Peptidase inhibitor I9
`XP_057775360.1`	Pfam	`PF00082`	Peptidase_S8	Domain	127	553	1.4e-48	166.4	Subtilase family
`XP_057775360.1`	Pfam	`PF02225`	PA	Domain	349	435	1.8e-10	41.5	PA domain
`XP_057775360.1`	Pfam	`PF17766`	fn3_6	Domain	631	728	5.6e-29	101.0	Fibronectin type-III domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919377.1
ATGTTCCCTTCATTTCTAGCTCTCCTTTGCATCCTGAATTTCAACCAACTCCTCACAGCACAAAACCCTAATCCCGACCACAACACCTTACAAACATACATCGTCCACGTCGAGCCTCAATCCAGCGATCTCAATGCCTTCTACGACACATTTTTCGCGACGGACGTGGCGGCGGCCGCGCCCCGCATTTTGCACCGCTACCGCCACGTGCTCACCGGCTTCTCCGCGAAGTTATCGGCCGACGAGTTAGAATCGCTTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994329
ATGTTCCCTTCATTTCTAGCTCTCCTTTGCATCCTGAATTTCAACCAACTCCTCACAGCACAAAACCCTAATCCCGACCACAACACCTTACAAACATACATCGTCCACGTCGAGCCTCAATCCAGCGATCTCAATGCCTTCTACGACACATTTTTCGCGACGGACGTGGCGGCGGCCGCGCCCCGCATTTTGCACCGCTACCGCCACGTGCTCACCGGCTTCTCCGCGAAGTTATCGGCCGACGAGTTAGAATCGCTTCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775360.1
MFPSFLALLCILNFNQLLTAQNPNPDHNTLQTYIVHVEPQSSDLNAFYDTFFATDVAAAAPRILHRYRHVLTGFSAKLSADELESLRHKEGFISARPERVYQLHTTHSPNFLGLIQNEGFWKGSNYGKGVIIGLLDTGITPGHPSFSDEGMPPPPAKWKGKCDLAPGACNNKLIGARRFGSGGAGTPADEVGHGTHTASTAGGNFVPGAGIFGNANGTAAGIAPSAHLAIYKVCALTGCPESDIMAGFDAAIEDGVDVLS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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