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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003924`

染色体: Chr07 坐标: 49551045-49552007 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003924`
名称	SmilChr07G003924
描述	uncharacterized SmilChr07G003924
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	49551045 - 49552007 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994330`
GeneID	`130994330`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994330`
原始查询	`LOC130994330`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693]; symbol=AT2G06105; hit=AT2G06105; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693]; symbol=AT2G06105; hit=AT2G06105; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT2G06105` (AT2G06105) aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693] identity=33.3; qcov=0.262; evalue=1.78e-06; confidence=weak
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13650 (Asp_protease_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994330

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057775361.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057775361.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057775361.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775361.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775361.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:49551117`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D3
`Chr7:49551121`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr7:49551139`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D3
`Chr7:49551165`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr7:49551243`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B107,B18,C10
`Chr7:49551247`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B69,C10,C42,D3
`Chr7:49551322`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B2,B91,C85
`Chr7:49551323`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B94,D3
`Chr7:49551362`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr7:49551365`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,B51,B65
`Chr7:49551406`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C21
`Chr7:49551468`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B127,B94,B96,C6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775361.1

275 aa

138

275

Asp_protease_2

PF13650 Asp_protease_2 105-196 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775361.1`	Pfam	`PF13650`	Asp_protease_2	Domain	105	196	3.7e-05	25.1	Aspartyl protease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919378.1
ATGTGCTTGGGAGAGGAGGACATGGTTGAAATAGAGAAGAGCAATGATGGAGGCATTTCTTCAAAAATGCAAAATGATAAGGAAAAGAAGAAGGAAACGTACAAAGCTCCACCTCCTTATTGCCCACCAATCCCCTTTCCTCAAAGGCTTCCCAAGAAGAATGTGGAGATTGAGTTCTCCAAATTCCTTGAAATTTTTCGGAAGAAGAAGAAATTGGAAGAATTTGAGATGGTCAACCTCACCGAAGAATGTTGTGCCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994330
ATGTGCTTGGGAGAGGAGGACATGGTTGAAATAGAGAAGAGCAATGATGGAGGCATTTCTTCAAAAATGCAAAATGATAAGGAAAAGAAGAAGGAAACGTACAAAGCTCCACCTCCTTATTGCCCACCAATCCCCTTTCCTCAAAGGCTTCCCAAGAAGAATGTGGAGATTGAGTTCTCCAAATTCCTTGAAATTTTTCGGAAGAAGAAGAAATTGGAAGAATTTGAGATGGTCAACCTCACCGAAGAATGTTGTGCCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775361.1
MCLGEEDMVEIEKSNDGGISSKMQNDKEKKKETYKAPPPYCPPIPFPQRLPKKNVEIEFSKFLEIFRKKKKLEEFEMVNLTEECCAVLQKKLPIKIKDPGSFTIPCDVGNGRCGKALCDLGASINLMPLSIFNKFEIGTIKPTTIALQMADRSVSYPKGIVEDVLVKVDNFIFPVDFVVLDMVEDKDVPLILGRPFLATRRALIDVAKAPKHKDGEERMKMEECKMMQVIEPCINLKEKLKKEKGEEKDPSLELKLLPTH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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