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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003958`

染色体: Chr07 坐标: 50211407-50212162 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003958`
名称	SmilChr07G003958
描述	uncharacterized SmilChr07G003958
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	50211407 - 50212162 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994338`
GeneID	`130994338`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994338`
原始查询	`LOC130994338`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968]; symbol=AT1G43760; hit=AT1G43760; species=arabidopsis; confidence=low
产物	DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968]; symbol=AT1G43760; hit=AT1G43760; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G43760` (AT1G43760) DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968] identity=29.7; qcov=0.725; evalue=6.15e-18; confidence=low
Rice	`Os04g0204200` - identity=29.4; qcov=0.677; evalue=1e-10; confidence=low
GO	GO:0003824 (catalytic activity)
KEGG	-
Pfam	PF03372 (Exo_endo_phos); PF14529 (Exo_endo_phos_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994338

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057775369.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057775369.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057775369.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775369.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775369.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:50211416`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	C32,C68
`Chr7:50211416`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr7:50211424`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B45,C35,C54
`Chr7:50211438`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,C58,C85
`Chr7:50211443`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr7:50211466`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B13,B78,B89,C31,C80
`Chr7:50211473`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,C45,C79
`Chr7:50211478`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,C45,C79
`Chr7:50211486`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B137,B17,C45,C79
`Chr7:50211489`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B38,B39,B78,C80,D3,D8
`Chr7:50211491`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C68
`Chr7:50211496`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B58,B8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775369.1

251 aa

126

251

Exo_endo_phos_2

Exo_endo_phos

PF14529 Exo_endo_phos_2 48-173 aa PF03372 Exo_endo_phos 54-170 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775369.1`	Pfam	`PF14529`	Exo_endo_phos_2	Domain	48	173	1.1e-06	29.2	Endonuclease-reverse transcriptase
`XP_057775369.1`	Pfam	`PF03372`	Exo_endo_phos	Domain	54	170	2.1e-06	28.4	Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919386.1
ATGGCTTTCAGGGGGGCCGAAGGTAGATCCAGAGGTCTACTTTGTGCTTGGAATAAAAACAAATTTGTGGCGACAAGCACGTGGGATACGGCGGGAGCAGTGATCGTGCAAGGGAATGGAGTCGAAAGCAACCAAAGCTTTTGTCTCATTAATGTGTATGCCCCTCAAGCTTCTGCTGAAAAGGGTGATCTTTGGGACAAATTACAGATTGTGGCGGCACAGAATAAGGATAGATGTGTTTGCATTATGGGGGATTTCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994338
ATGGCTTTCAGGGGGGCCGAAGGTAGATCCAGAGGTCTACTTTGTGCTTGGAATAAAAACAAATTTGTGGCGACAAGCACGTGGGATACGGCGGGAGCAGTGATCGTGCAAGGGAATGGAGTCGAAAGCAACCAAAGCTTTTGTCTCATTAATGTGTATGCCCCTCAAGCTTCTGCTGAAAAGGGTGATCTTTGGGACAAATTACAGATTGTGGCGGCACAGAATAAGGATAGATGTGTTTGCATTATGGGGGATTTCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775369.1
MAFRGAEGRSRGLLCAWNKNKFVATSTWDTAGAVIVQGNGVESNQSFCLINVYAPQASAEKGDLWDKLQIVAAQNKDRCVCIMGDFNVIREASERAGRGESFGTSDMSRFNNFIRDSELCEVRTQGRRFTWYQANGGCKSKLDRFLINDFWNVSWPSSVGRCLQRPVSDHCPILLSTKTVDWGPKPFRFINAWTSHPEFLPVVQNVWDEQNVEGWGWFVFKEKLKRTKFALKEWNKNCFGLFDNEIDRGKE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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