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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G003967`

染色体: Chr07 坐标: 50489365-50491775 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G003967`
名称	SmilChr07G003967
描述	uncharacterized SmilChr07G003967
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	50489365 - 50491775 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994340`
GeneID	`130994340`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994340`
原始查询	`LOC130994340`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF20167 (Retrotransp-rel)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994340

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775371.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775371.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775371.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775371.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057775371.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:50489369`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	23	A7,B106,B20,B22,B31,B32,B49,B74,B79,B87,B88,B96,C12,C24,C42,C44,C55,C60,C62,C65,C86,C87,D8
`Chr7:50489418`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	73	A1,A13,A15,A18,A19,A21,A23,A25,A7,A8,B10,B100,B101,B109,B11,B110,B111,B113,B114,B118,B119,B121,B123,B125,B127,B131,B138,B18,B2,B22,B26,B3,B31,B34,B53,B54,B60,B66,B70,B72,B75,B79,B82,B86,B89,B99,C2,C21,C22,C23,C26,C34,C36,C37,C40,C43,C44,C47,C60,C67,C69,C7,C70,C72,C77,C78,C8,C85,C86,C9,D5,D6,D7
`Chr7:50489442`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr7:50489451`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	87	A10,A15,A18,A19,A21,A23,A25,A7,B10,B101,B109,B11,B112,B114,B118,B119,B121,B123,B13,B131,B138,B14,B15,B18,B2,B22,B24,B26,B3,B31,B34,B39,B41,B44,B47,B48,B49,B51,B53,B54,B60,B63,B65,B66,B7,B72,B73,B75,B79,B82,B86,B89,B95,B97,B98,B99,C10,C11,C19,C23,C25,C26,C29,C3,C34,C36,C39,C43,C47,C49,C55,C60,C67,C7,C72,C74,C76,C77,C8,C83,C86,C9,D1,D5,D6,D7,D8
`Chr7:50489468`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B41,B94,C11,C48
`Chr7:50489482`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B121,B56,B90,C4
`Chr7:50489490`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B107,B117,B28,B84,C27,C35
`Chr7:50489491`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	A23,B109,B3,B37,B54,C34,C43,C77
`Chr7:50489499`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,B64
`Chr7:50489500`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C31,C72,C75
`Chr7:50489508`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B122
`Chr7:50489512`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775371.1

331 aa

166

331

Retrotransp-rel

PF20167 Retrotransp-rel 10-162 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775371.1`	Pfam	`PF20167`	Retrotransp-rel	Domain	10	162	3.7e-20	73.3	Putative plant retrotransposon-related domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919388.1
ATGTGGGGCACGGTTGTCAATGTTTTTCCCTATGATGCTGAGATTGTTAGAGAGTTCTATGTTAATCTGATGACAGAGGCTTTTGACCCAAAATCTGTTAAGTATGGGAAAGTATTTGTTAGGGGTAAGGGAGTTGACTGGAGGGAAACTACTAACACTGATGATGTTGAGGTTGATGATGATGAGATGACTAGGGAGTTGACTGGAGGGAAACTTAAGGCATGGACCTCGAAGTTTGCTGCATCCACTTTGTCTTGGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994340
ATGTGGGGCACGGTTGTCAATGTTTTTCCCTATGATGCTGAGATTGTTAGAGAGTTCTATGTTAATCTGATGACAGAGGCTTTTGACCCAAAATCTGTTAAGTATGGGAAAGTATTTGTTAGGGGTAAGGGAGTTGACTGGAGGGAAACTACTAACACTGATGATGTTGAGGTTGATGATGATGAGATGACTAGGGAGTTGACTGGAGGGAAACTTAAGGCATGGACCTCGAAGTTTGCTGCATCCACTTTGTCTTGGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775371.1
MWGTVVNVFPYDAEIVREFYVNLMTEAFDPKSVKYGKVFVRGKGVDWRETTNTDDVEVDDDEMTRELTGGKLKAWTSKFAASTLSWKYSVLHKIAVYNWLPSKNTTALTKEQAEFIFKVGKPLAFNFGEQMFANISRAAFKSTGGSMLPFPSLIYNLLVQQGLKERENDVLVEEKNLLEFSKTLLTPDRVKDLPYEPPRVGPPLSPQPDDEADSAEAKIDKYGDDEDVDRATAPDVALDVSNIISVKAHLTKETSTSRKG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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