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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003541`

染色体: Chr01 坐标: 53997931-54000593 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003541`
名称	SmilChr01G003541
描述	uncharacterized SmilChr01G003541
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	53997931 - 54000593 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994341`
GeneID	`130994341`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994341`
原始查询	`LOC130994341`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0589500; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os01g0589500; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G09830` (AT4G09830) nuclear receptor family 2 group C protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826572] identity=40.6; qcov=1.17; evalue=5.09e-37; confidence=medium
Rice	`Os01g0589500` - identity=43.6; qcov=1.14; evalue=7.33e-44; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994341

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775373.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057775373.1`
3	Nuclear body	核内小体	0.80000	`XP_057775373.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775373.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775373.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:53998097`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr1:53998142`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr1:53998286`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B84,C39
`Chr1:53998375`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr1:53998418`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919390.1
TAGGTGGAATTAAAAGAAAAGAAAAAGCAAAAAGCAGAAAGCAAAAAAGAAAAGCCACCTGGCAGCGCAGAAGCACGAAATGGAGCACCCCCACCGCATATAAAAATCTGCGGTTTCCTTCTCCATTTCACCTTCCTCATTGGAATCGAAACCACGCCAATTATCAATTTAATTTTTCACCCAAAAACACACACACATACACAACGCGTACTGACCGTCCACCACTCTTAGGGTTTTCTTTCCGCACAATCCAAGCCAAG...

XM_057919395.1
ATAAAAATCTGCGGTTTCCTTCTCCATTTCACCTTCCTCATTGGAATCGAAACCACGCCAATTATCAATTTAATTTTTCACCCAAAAACACACACACATACACAACGCGTACTGACCGTCCACCACTCTTAGGGTTTTCTTTCCGCACAATCCAAGCCAAGAACAAATATTCCAATTTCCGTTTCGGAGTTTTTCATTTTTTATCGTTTTGCGTTTCTCTTGCCAATGGCGAAGAAGAGGAAATCCGACGCGACGCGACT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130994341
ATGGCGAAGAAGAGGAAATCCGACGCGACGCGACTGGACGAGGTGGATCGGGGCATGTACACCGCTTTCTGCGGCGCCGCCAACTCCCTCTCGCAGCTCTACTCCCAGGCCGTCAACCACCAGCGCCTCTCCTTCCACGCCGGCGAACGCCACGCCATGAACGAACTCGATTTTGGGATGGAGGAGACTCCATCTTTGCCGCTCCTCAATCAGCAACCTTCTCAAACTGCAATGCTATCAACTCAGACAGGAATCCCAGT...

LOC130994341
ATGGCGAAGAAGAGGAAATCCGACGCGACGCGACTGGACGAGGTGGATCGGGGCATGTACACCGCTTTCTGCGGCGCCGCCAACTCCCTCTCGCAGCTCTACTCCCAGGCCGTCAACCACCAGCGCCTCTCCTTCCACGCCGGCGAACGCCACGCCATGGAGAAGCTTTATAGCTGGCTTTTAAGGCAGCAAGAAAATGGTATTAGAGTGATGCCCGGTGATATACTCGCCTATGTGCAGAACGAACTCGATTTTGGGAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057775373.1
MAKKRKSDATRLDEVDRGMYTAFCGAANSLSQLYSQAVNHQRLSFHAGERHAMEKLYSWLLRQQENGIRVMPGDILAYVQNELDFGMEETPSLPLLNQQPSQTAMLSTQTGIPVSNVFGPSAAGQGLRSGNSDQTKNTVFSNALSSPVRRSLQHYHLSQGGQYGNNATRSNDCSGNQTRDPNPPSSNDTSMEMHADSPGHDSPY

XP_057775378.1
MAKKRKSDATRLDEVDRGMYTAFCGAANSLSQLYSQAVNHQRLSFHAGERHAMNELDFGMEETPSLPLLNQQPSQTAMLSTQTGIPVSNVFGPSAAGQGLRSGNSDQTKNTVFSNALSSPVRRSLQHYHLSQGGQYGNNATRSNDCSGNQTRDPNPPSSNDTSMEMHADSPGHDSPY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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