当前解析结果
SmilChr07G004051| 统一基因 ID | SmilChr07G004051 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G004051 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G004051 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 51818906 - 51819454 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130994369 |
|---|---|
| GeneID | 130994369 |
| locus_tag | - |
| NCBI 名称 | LOC130994369 |
| 原始查询 | LOC130994369 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| 拟南芥 | -- |
| 水稻 | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF01107 (MP) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994369 |
预测得分表示模型支持程度,不能作为定位概率;所有候选均需实验验证。
当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定;当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选,预测得分表示模型支持程度,不是校准概率,也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签,应谨慎解读其在植物中的适用性。 四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核,原始投票全部一致。
| 排序 | 定位位置 | 预测得分 | 蛋白 ID |
|---|---|---|---|
| 1 | 细胞质 | 1.00000 | XP_057775397.1 |
| 2 | 细胞核 | 0.60000 | XP_057775397.1 |
| 3 | 自噬囊泡 | 0.40000 | XP_057775397.1 |
| 4 | 细胞质囊泡 | 0.20000 | XP_057775397.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | 参考等位基因 | 变异等位基因 | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:51818916 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B128,C4 |
Chr7:51818917 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B112,B128,C2,C39,C4 |
Chr7:51818918 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B8 |
Chr7:51818922 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C12,C7 |
Chr7:51818939 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B104,B128,C4,D11 |
Chr7:51818972 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B28 |
Chr7:51818976 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B75 |
Chr7:51818982 |
CT |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 14 | A10,A13,B139,B90,C12,C27,C39,C47,C54,C68,C84,C9,D4,D8 |
Chr7:51818999 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B41 |
Chr7:51819001 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B75,D4 |
Chr7:51819002 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 4 | B111,B135,C22,C49 |
Chr7:51819002 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B111,B135,C22,C49 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057775397.1PF01107
MP 72-181 aa
| 蛋白 ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | 得分 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057775397.1 |
Pfam | PF01107 |
MP | Family | 72 | 181 | 9.2e-17 | 62.0 | Viral movement protein (MP) |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。