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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004063`

染色体: Chr07 坐标: 51921631-51923358 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004063`
名称	SmilChr07G004063
描述	uncharacterized SmilChr07G004063
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	51921631 - 51923358 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994373`
GeneID	`130994373`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994373`
原始查询	`LOC130994373`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF20167 (Retrotransp-rel)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994373

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775400.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057775400.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775400.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775400.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057775400.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:51921636`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	184	A1,A10,A11,A13,A14,A15,A16,A2,A21,A22,A24,A3,A4,A5,A6,A8,A9,B10,B102,B103,B105,B106,B107,B108,B111,B114,B117,B118,B119,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B130,B131,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B17,B18,B19,B20,B21,B24,B25,B26,B27,B28,B3,B30,B31,B32,B33,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B44,B45,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B58,B59,B6,B60,B63,B64,B65,B66,B67,B69,B7,B71,B73,B74,B75,B76,B77,B78,B8,B80,B82,B83,B84,B87,B88,B9,B90,B91,B92,B96,B98,C10,C11,C12,C14,C16,C17,C18,C19,C20,C21,C22,C23,C24,C25,C26,C27,C28,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C4,C41,C42,C46,C47,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C66,C67,C68,C69,C70,C72,C73,C75,C76,C78,C79,C8,C83,C84,C86,C87,D3,D4,D6,D7,D9
`Chr7:51921646`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A25,B61
`Chr7:51921650`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B84,B9,D11
`Chr7:51921661`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr7:51921691`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,B94
`Chr7:51921715`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B34,C39,C43
`Chr7:51921723`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	A16,A23,B104,B107,B21,B8,B80,C41,C42,C59,C82,D9
`Chr7:51921745`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,B46
`Chr7:51921782`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B28,B46
`Chr7:51921806`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr7:51921860`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B73,B91,C26,C39
`Chr7:51921870`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B29,C25,C79,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775400.1

546 aa

273

546

Retrotransp-rel

PF20167 Retrotransp-rel 263-426 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775400.1`	Pfam	`PF20167`	Retrotransp-rel	Domain	263	426	1.2e-24	87.9	Putative plant retrotransposon-related domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919417.1
ATGGCGCCTTGTCCTGGTTCCTCTGCTAAGGTTGACGAAGAACTCACGAAGGGGAAATCTCCTCTGCAAAACCCTACTGTTCAAGTGGTTTCAGAAAAATCCACAGGACATCCAGCTTTTGGTGTTACTCAACATCAAACTCCTCTTACCACTCCAAGCGAAGAGTCAATTCCGTCTTCAAAAGAGGAATCCGCGCATGCTCCTCAAGATATCTCTTTGGAGAGAATTGGGGAAATTGCCAAAGAGGCTCTGCTTGATCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994373
ATGGCGCCTTGTCCTGGTTCCTCTGCTAAGGTTGACGAAGAACTCACGAAGGGGAAATCTCCTCTGCAAAACCCTACTGTTCAAGTGGTTTCAGAAAAATCCACAGGACATCCAGCTTTTGGTGTTACTCAACATCAAACTCCTCTTACCACTCCAAGCGAAGAGTCAATTCCGTCTTCAAAAGAGGAATCCGCGCATGCTCCTCAAGATATCTCTTTGGAGAGAATTGGGGAAATTGCCAAAGAGGCTCTGCTTGATCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775400.1
MAPCPGSSAKVDEELTKGKSPLQNPTVQVVSEKSTGHPAFGVTQHQTPLTTPSEESIPSSKEESAHAPQDISLERIGEIAKEALLDLASQPGSDVDKASDVDPEESTDVIDVDTFVPDKKSRKRKAGMASLRRSSRSKSTRVIPSTLNLPSREDNDVGPTSQPPVLKPKVEHSSTSKSGKVYSASHTTSPRISCSGSSSESEVEVSKSYSTRFYTREAKNALKVLAARKFHNDRRADEDFFSKYKLDILLQDRSMWGTVV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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