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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004121`

染色体: Chr07 坐标: 52881909-52884195 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004121`
名称	SmilChr07G004121
描述	uncharacterized SmilChr07G004121
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	52881909 - 52884195 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994391`
GeneID	`130994391`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994391`
原始查询	`LOC130994391`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=24.9; qcov=0.893; evalue=1.5e-34; confidence=weak
Rice	`Os06g0704400` - identity=33.9; qcov=0.877; evalue=1.97e-58; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF03108 (DBD_Tnp_Mut); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994391

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775417.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775417.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775417.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775417.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057775417.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:52882033`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C35,C36
`Chr7:52882034`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B102,C50,D4
`Chr7:52882045`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	16	A13,A4,A6,A7,B33,B45,B54,B69,B92,C21,C26,C29,C35,C54,C57,D9
`Chr7:52882051`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B128,C4
`Chr7:52882079`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B62,B87
`Chr7:52882091`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B125
`Chr7:52882507`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	A18,A20,B10,B15,B5,B82,B95,C31,C37,C54
`Chr7:52882557`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	23	A24,A7,B112,B132,B133,B17,B26,B34,B36,B64,B66,B75,B88,B94,C16,C33,C37,C38,C58,C80,C82,D10,D6
`Chr7:52882574`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B29
`Chr7:52882574`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B29
`Chr7:52882591`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	A20
`Chr7:52882591`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775417.1

440 aa

220

440

DBD_Tnp_Mut

Transposase_mut

MULE

PF03108 DBD_Tnp_Mut 56-117 aa PF00872 Transposase_mut 237-382 aa PF10551 MULE 250-345 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775417.1`	Pfam	`PF03108`	DBD_Tnp_Mut	Family	56	117	4.6e-07	30.1	MuDR family transposase
`XP_057775417.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	237	382	6.5e-07	29.3	Transposase, Mutator family
`XP_057775417.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	250	345	1.6e-14	54.8	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919434.1
ATGGGAGAGAGTGACGAGTTTGGTTTGTATATTCATCATGAAGAAGAAAGATTGTCTGAATATGAGGATTCTGACAAAGAGGGGTTTGAAAGTAGTAACTTAGATGGTCAAGTTGTTAGGAATAAACACCCTAAAGCTGTGTATGATCCAAGGGGAGATATTGTAGAGTTCAAGCTTGTTCTAGGCATGTGGTTTGAGGATACTTTTCAGTGCAAGAAAGCACTAATATCATGGAGCATTGTTAAAGGTCATCCAATTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994391
ATGGGAGAGAGTGACGAGTTTGGTTTGTATATTCATCATGAAGAAGAAAGATTGTCTGAATATGAGGATTCTGACAAAGAGGGGTTTGAAAGTAGTAACTTAGATGGTCAAGTTGTTAGGAATAAACACCCTAAAGCTGTGTATGATCCAAGGGGAGATATTGTAGAGTTCAAGCTTGTTCTAGGCATGTGGTTTGAGGATACTTTTCAGTGCAAGAAAGCACTAATATCATGGAGCATTGTTAAAGGTCATCCAATTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775417.1
MGESDEFGLYIHHEEERLSEYEDSDKEGFESSNLDGQVVRNKHPKAVYDPRGDIVEFKLVLGMWFEDTFQCKKALISWSIVKGHPIHFRRVNKDQCEAYCEEPCKWRIYASTNKKERSMVVKVLGQDHTCTFAIGNKQASYKWLGEEYTKVFRVRPQICVDEFRNDVKRRFNIAIPNGRLYRAKAHALQVLRGTVKRHHNKLRSYIAELMRVDREGRFELLCEDGTIFQGLYIEFLAFKKGFLEGCMPIIGLDGCLLKTH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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