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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004145`

染色体: Chr07 坐标: 53276153-53277583 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004145`
名称	SmilChr07G004145
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	53276153 - 53277583 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994393`
GeneID	`130994393`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994393`
原始查询	`LOC130994393`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT3G07040` (RPM1) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819889] identity=34.7; qcov=0.82; evalue=2.31e-20; confidence=low
Rice	`Os08g0424700` (P0456B03.103) - identity=38.5; qcov=0.653; evalue=4.54e-29; confidence=medium
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994393

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057775420.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057775420.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775420.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775420.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775420.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:53276165`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B15,B26,B85,B89
`Chr7:53276211`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,B123,C36
`Chr7:53276274`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B8,C10,C74
`Chr7:53276303`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	14	A1,B117,B130,B139,B3,B4,B41,B65,B75,B78,C51,C52,C6,C7
`Chr7:53276359`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B8,C10,C74
`Chr7:53276395`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr7:53277136`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B44,C53,C68
`Chr7:53277139`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	17	B102,B18,B20,B30,B32,B38,B44,B86,C26,C49,C50,C60,C65,C70,D3,D4,D7
`Chr7:53277153`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,C36
`Chr7:53277180`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B34,B59,B67,B77,C63
`Chr7:53277189`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B8,C10,C74
`Chr7:53277195`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,B99,C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775420.1

239 aa

120

239

NB-ARC

PF00931 NB-ARC 89-155 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775420.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	89	155	1.6e-15	57.8	NB-ARC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919437.1
ATGCACCAAGCAGACCTCAGGTGCTTGGAGTATCTGCGGCAGATAATAGAAGACATGGGTGCTATCATCGACAAGTCCAATCAATTGAAGGAGAAACAAAGATTCAGAGAGGAGCATTCAACACCTCCTCTTACTCTTAGTCTTACTCAGACCAGAGAAGAAACTGCTATGGTGGGATTTGGTGATGAGTTGATTCAACTTCTTGACGAGCTCACCGGTCATCGATCCAATCTGCATATCATCTCAATCGTCGGTATGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994393
ATGCACCAAGCAGACCTCAGGTGCTTGGAGTATCTGCGGCAGATAATAGAAGACATGGGTGCTATCATCGACAAGTCCAATCAATTGAAGGAGAAACAAAGATTCAGAGAGGAGCATTCAACACCTCCTCTTACTCTTAGTCTTACTCAGACCAGAGAAGAAACTGCTATGGTGGGATTTGGTGATGAGTTGATTCAACTTCTTGACGAGCTCACCGGTCATCGATCCAATCTGCATATCATCTCAATCGTCGGTATGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775420.1
MHQADLRCLEYLRQIIEDMGAIIDKSNQLKEKQRFREEHSTPPLTLSLTQTREETAMVGFGDELIQLLDELTGHRSNLHIISIVGMGGMDDILSVEAWNEVRCFFPDNGSGSRIVLTTRLSDVANNCGSSCFLKNLLDENESWELFCKKAFQNEDCPTELEEIGRKIVKLCNGLALSIVVIGGRLLKSSRTVECWKSVAKDIELSPNSKEKQESFDVLFSSYDHLPPHLKPCFLYIGVL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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