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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004146`

染色体: Chr07 坐标: 53279792-53282950 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004146`
名称	SmilChr07G004146
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	53279792 - 53282950 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994394`
GeneID	`130994394`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994394`
原始查询	`LOC130994394`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=26.6; qcov=0.857; evalue=1.99e-57; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=31.2; qcov=0.664; evalue=3.71e-67; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994394

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057775421.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057775421.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057775421.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775421.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775421.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:53279798`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr7:53279814`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B63,B91,C61
`Chr7:53279854`	`T`	`TCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	12	A13,B105,B125,B136,B138,B25,B44,B49,B61,C24,C27,D6
`Chr7:53279856`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	12	A13,B105,B125,B136,B138,B25,B44,B49,C24,C27,C29,D6
`Chr7:53279865`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B129,B136,B87,C5
`Chr7:53279900`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B136,B44,B65,D6
`Chr7:53279907`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr7:53279951`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,C77
`Chr7:53279990`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B65,C26,C81
`Chr7:53280073`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	181	A1,A10,A11,A16,A18,A19,A21,A22,A3,A4,A5,A6,A7,A9,B1,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B111,B112,B113,B117,B118,B119,B12,B120,B121,B122,B123,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B134,B135,B136,B138,B139,B140,B16,B17,B18,B2,B21,B22,B23,B25,B27,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B34,B35,B36,B37,B4,B40,B41,B45,B46,B47,B48,B49,B50,B52,B53,B54,B55,B56,B58,B59,B60,B61,B63,B64,B65,B68,B69,B7,B71,B72,B73,B75,B76,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B86,B87,B88,B90,B91,B92,B94,B96,B98,B99,C1,C10,C11,C13,C16,C17,C18,C19,C2,C21,C22,C23,C25,C26,C27,C29,C30,C31,C33,C35,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C43,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C69,C7,C70,C71,C72,C74,C75,C77,C78,C8,C80,C81,C82,C85,C9,D1,D2,D3,D4,D9
`Chr7:53280077`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	167	A1,A10,A11,A16,A18,A19,A21,A22,A3,A4,A5,A6,A7,A9,B1,B101,B102,B103,B105,B106,B107,B108,B111,B112,B113,B117,B118,B119,B12,B120,B121,B122,B123,B126,B128,B13,B130,B131,B132,B136,B138,B139,B140,B16,B17,B18,B2,B21,B22,B23,B25,B27,B3,B30,B31,B32,B33,B34,B35,B37,B4,B40,B41,B45,B46,B47,B48,B49,B52,B54,B55,B56,B58,B59,B60,B61,B63,B64,B65,B68,B69,B7,B71,B73,B75,B76,B78,B79,B80,B81,B83,B84,B86,B88,B90,B91,B92,B94,B96,B98,B99,C1,C10,C13,C16,C17,C18,C19,C2,C21,C22,C23,C25,C26,C27,C29,C30,C31,C33,C35,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C43,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C69,C7,C70,C71,C72,C74,C75,C77,C78,C8,C80,C81,C82,C85,C9,D1,D2,D3,D4,D9
`Chr7:53280119`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B28,B8,C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775421.1

1052 aa

526

1052

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 324-485 aa PF23559 WHD_DRP 581-641 aa PF23598 LRR_14 692-983 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775421.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	324	485	2.5e-44	151.6	NB-ARC domain
`XP_057775421.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	581	641	4.4e-17	62.6	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057775421.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	692	983	4.6e-14	52.7	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919438.1
ATGGCAGCTTATGCAGCTCTTGCTTCTCTCTTGAACACTACTCAGCAGATGATGACCCATCCTCCTATTTCCACTTCTTTCCACAACATTCAGATCCAATCTCTCGAGGAAAAGGCTGCTTTGTTGCTTGATTTTATAGAGACCTACAATTATGTTGGTGGAGTTAGCGAAGAAGCACAAGATCTGGAAAGCCTAATCGCATCTGCTGCTCATACAGCTGAAGATATGATTGAATCTCACATCGTCAATCAACTCCTTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994394
ATGGCAGCTTATGCAGCTCTTGCTTCTCTCTTGAACACTACTCAGCAGATGATGACCCATCCTCCTATTTCCACTTCTTTCCACAACATTCAGATCCAATCTCTCGAGGAAAAGGCTGCTTTGTTGCTTGATTTTATAGAGACCTACAATTATGTTGGTGGAGTTAGCGAAGAAGCACAAGATCTGGAAAGCCTAATCGCATCTGCTGCTCATACAGCTGAAGATATGATTGAATCTCACATCGTCAATCAACTCCTTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775421.1
MAAYAALASLLNTTQQMMTHPPISTSFHNIQIQSLEEKAALLLDFIETYNYVGGVSEEAQDLESLIASAAHTAEDMIESHIVNQLLPLSAHDQEIPLSSSLYLQKESTIEEKNEAAVGDVDQFHGGSNQAIEEPAPHVAKGGCWINFMQLIKRKRAIQPKNEAAVGDVNQFHGESNQTIEEHAPHVAAREARDLESLIASAAHTAEDMIESHIVNQLLPVSAEDGEAALSFSLYLQKKRAIQEKNAAAVGDVDQFHGEYN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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