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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004155`

染色体: Chr07 坐标: 53398052-53399319 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004155`
名称	SmilChr07G004155
描述	F-box protein At5g41720-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	53398052 - 53399319 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994400`
GeneID	`130994400`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994400`
原始查询	`LOC130994400`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein At5g41720-like
产物	F-box protein At5g41720-like
Arabidopsis	`AT1G64295` (AT1G64295) F-box associated ubiquitination effector family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842735] identity=29.4; qcov=0.918; evalue=1.07e-24; confidence=low
Rice	`Os10g0391200` (OsFbox550) - identity=29.2; qcov=0.428; evalue=4.25e-10; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994400

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775426.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057775426.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057775426.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057775426.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775426.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:53398612`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C15,C45,C6
`Chr7:53398672`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B46,C39,C56,C68,C76
`Chr7:53398677`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C39,C68,C76
`Chr7:53398719`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr7:53398732`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B102,B41,C15,C78
`Chr7:53398768`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr7:53398842`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B45,C68,D9
`Chr7:53398864`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,B91
`Chr7:53398968`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr7:53398978`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr7:53398994`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,D6
`Chr7:53399019`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	A10,B35,B72,C64

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775426.1

304 aa

152

304

F-box-like

F-box

PF12937 F-box-like 5-41 aa PF00646 F-box 5-42 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775426.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	5	41	1.4e-07	31.9	F-box-like
`XP_057775426.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	5	42	9.9e-08	32.3	F-box domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919443.1
ATGGGGTCTGCAGAATTACCGTCGGAGTTGATATTCGAAATTCTGAGCCGAACGTCGTTGGAAACCCTAGAACGATGCAAGGCGGTTTCAAAGAGTTGGAAGCACATTATTTACGAGCCTTCTTTTCTCCCTCTCCACTCCCAAAGAACCAATTCCCTCTTCGGCTATTTCTTCCAAGACGTCAGACGCATTGCTAAATTTCCGTCCGCGTTCGTATCCTCCGCCCCCGGCGCCGCCGCTGCCGCAGCCATCAAAGTAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994400
ATGGGGTCTGCAGAATTACCGTCGGAGTTGATATTCGAAATTCTGAGCCGAACGTCGTTGGAAACCCTAGAACGATGCAAGGCGGTTTCAAAGAGTTGGAAGCACATTATTTACGAGCCTTCTTTTCTCCCTCTCCACTCCCAAAGAACCAATTCCCTCTTCGGCTATTTCTTCCAAGACGTCAGACGCATTGCTAAATTTCCGTCCGCGTTCGTATCCTCCGCCCCCGGCGCCGCCGCTGCCGCAGCCATCAAAGTAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775426.1
MGSAELPSELIFEILSRTSLETLERCKAVSKSWKHIIYEPSFLPLHSQRTNSLFGYFFQDVRRIAKFPSAFVSSAPGAAAAAAIKVTWPCDDMEILASCDQGILCCQRRICYNKRFYACKPATSQWQALPNPKLRYETDAVAIVVVRSTPLRYIIARLYHSETMQHHCEIFDSETWAWEKIECAAPYGEIIEYCRRAVTTAGRFFHWLTVNGNVLTLDVKRRSFRCSPLLQCDPACKWKELVEYEGELGFARMVEDGDRR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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