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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004197`

染色体: Chr07 坐标: 54017794-54018509 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004197`
名称	SmilChr07G004197
描述	uncharacterized SmilChr07G004197
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	54017794 - 54018509 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994411`
GeneID	`130994411`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994411`
原始查询	`LOC130994411`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0006508 (proteolysis); GO:0008234 (cysteine-type peptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02902 (Peptidase_C48)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994411

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775437.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775437.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775437.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775437.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057775437.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:54017853`	`T`	`TGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B25,C61
`Chr7:54017853`	`T`	`TGG`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B25,C61
`Chr7:54017880`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B103,C27
`Chr7:54017880`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B103,C27
`Chr7:54017924`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,C61
`Chr7:54017936`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B25,C61
`Chr7:54017936`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B25,C61
`Chr7:54017980`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	31	A14,A16,A5,B108,B112,B115,B121,B126,B13,B136,B16,B17,B18,B34,B35,B41,B51,B52,B60,B79,C15,C30,C49,C6,C63,C76,C8,C83,D1,D6,D9
`Chr7:54017989`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B135,C39,C69,D5
`Chr7:54017998`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr7:54018008`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D10
`Chr7:54018008`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775437.1

181 aa

181

Peptidase_C48

PF02902 Peptidase_C48 8-115 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775437.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	8	115	0.00019	22.0	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919454.1
ATGCGGTTGAAGCACATTTATCTCGCAAATATAGACATGTTTTTTTTCCCAATTTGCCGAGTGATGAAATATCACGTTATTTGCGTGGACGTGAGGAAGGAAAGAGTCTATATCTTGGATAGCCAGAATGAAACCGTCGAGAACTGTCGGGATGAGAAGTACTCGACTACAGTTGATCTTGTGAAAAGTATGCTAGCGGATTATATGGCACATGCAGGGCAAATACATAAAAGCAATATTGTGAAACGCTGTAAGTTATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994411
ATGCGGTTGAAGCACATTTATCTCGCAAATATAGACATGTTTTTTTTCCCAATTTGCCGAGTGATGAAATATCACGTTATTTGCGTGGACGTGAGGAAGGAAAGAGTCTATATCTTGGATAGCCAGAATGAAACCGTCGAGAACTGTCGGGATGAGAAGTACTCGACTACAGTTGATCTTGTGAAAAGTATGCTAGCGGATTATATGGCACATGCAGGGCAAATACATAAAAGCAATATTGTGAAACGCTGTAAGTTATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775437.1
MRLKHIYLANIDMFFFPICRVMKYHVICVDVRKERVYILDSQNETVENCRDEKYSTTVDLVKSMLADYMAHAGQIHKSNIVKRCKLSVMHIKWGDFKNINDTGVYMMRHMETFMGESSALWTCGLAPKLKKQLNLLRVRYCASLLGWDKNSTKDAVSVSANARFDTYFGDASVNIDAKLLG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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