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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004201`

染色体: Chr07 坐标: 54090843-54091921 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004201`
名称	SmilChr07G004201
描述	uncharacterized SmilChr07G004201
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	54090843 - 54091921 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994412`
GeneID	`130994412`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994412`
原始查询	`LOC130994412`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os09g0268600; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os09g0268600; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=28.6; qcov=0.675; evalue=6.31e-11; confidence=low
Rice	`Os09g0268600` - identity=28.3; qcov=0.838; evalue=2.7e-19; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994412

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057775439.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057775439.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057775439.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775439.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775439.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:54090890`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,B54,B79
`Chr7:54090894`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	17	B1,B100,B105,B113,B127,B2,B37,B49,B79,B80,B91,B94,C5,C51,C53,C61,D2
`Chr7:54090895`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	21	A13,A24,B106,B117,B122,B140,B24,B35,B43,B51,B65,B74,C17,C28,C44,C52,C56,C64,C68,C8,D5
`Chr7:54090901`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B134,C61
`Chr7:54090914`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr7:54090927`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	D11,D4
`Chr7:54090927`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D11,D4
`Chr7:54090928`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	17	A16,A18,A4,B127,B134,B27,B47,B70,B72,C12,C42,C43,C56,C6,C61,C8,D3
`Chr7:54091256`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr7:54091258`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B74,C31,C5
`Chr7:54091274`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,C77
`Chr7:54091282`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B18,B19,C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775439.1

228 aa

114

228

SWIM

PF04434 SWIM 87-117 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775439.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	87	117	3e-07	30.5	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919456.1
ATGACGTCGAATGCTGCCGAGACGAAGAAAAGTAGACTGTTGTGGGCACGACGCCTCCCGGTTGCTTCATTGATCGAGACCTATCGAGCCATTATGGAGAAATGGTTCGATAGGCGACGCATCTCGGCTGCATCGAGGTCACATGAGTTGACTGAGGTAGTAGAGGGGAAGTTTCATGTGGCTGTCGAAGCGGGTCGGCAATTGGTTGTTCGAGGGACGACGACGCACATGTTTAGTGTTGAGGATGATCATGCATTCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994412
ATGACGTCGAATGCTGCCGAGACGAAGAAAAGTAGACTGTTGTGGGCACGACGCCTCCCGGTTGCTTCATTGATCGAGACCTATCGAGCCATTATGGAGAAATGGTTCGATAGGCGACGCATCTCGGCTGCATCGAGGTCACATGAGTTGACTGAGGTAGTAGAGGGGAAGTTTCATGTGGCTGTCGAAGCGGGTCGGCAATTGGTTGTTCGAGGGACGACGACGCACATGTTTAGTGTTGAGGATGATCATGCATTCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775439.1
MTSNAAETKKSRLLWARRLPVASLIETYRAIMEKWFDRRRISAASRSHELTEVVEGKFHVAVEAGRQLVVRGTTTHMFSVEDDHAFYIVDLENRTCSCAQFDLDDIPCCHACAAIRRAGLQVTDFVGRYFKQSVLLATYMERIVPVPHPTYWNVPDEISAYVVKPPDITVHAGRPKLSRARSAVEGPPNSGPPNSRPQGFWGEQGLNGLCTWLGPNRVQFLATVYGRT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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