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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004222`

染色体: Chr07 坐标: 54430228-54434806 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004222`
名称	SmilChr07G004222
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	54430228 - 54434806 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994416`
GeneID	`130994416`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994416`
原始查询	`LOC130994416`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
Arabidopsis	`AT3G46530` (RPP13) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823806] identity=32.7; qcov=0.477; evalue=1.53e-59; confidence=low
Rice	`Os11g0633500` - identity=35.6; qcov=0.348; evalue=7.63e-65; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994416

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057775444.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057775444.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775444.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775444.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775444.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:54430427`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B114,C41
`Chr7:54430546`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	15	A9,B102,B114,B22,B28,B41,B50,B59,B67,C16,C28,C39,C41,C53,C75
`Chr7:54430587`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr7:54430614`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B138,B72,C34,C72
`Chr7:54430621`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,D4
`Chr7:54430658`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr7:54430665`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr7:54432113`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B23,B80,B98,C78
`Chr7:54432141`	`TCC`	`*`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B118,B134,B94,C19,D8
`Chr7:54432153`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	46	A13,A14,A16,A2,A21,A8,B106,B110,B113,B123,B124,B133,B135,B136,B20,B22,B24,B27,B29,B3,B30,B37,B39,B42,B46,B50,B51,B52,B66,B71,B73,B81,B83,B88,B99,C15,C22,C25,C29,C5,C50,C56,C87,D4,D5,D8
`Chr7:54432160`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,B114,B17,B73
`Chr7:54432203`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B54,C5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775444.1

1033 aa

516

1033

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 189-350 aa PF23559 WHD_DRP 441-506 aa PF23598 LRR_14 565-852 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775444.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	189	350	5.3e-43	147.3	NB-ARC domain
`XP_057775444.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	441	506	2.9e-17	63.2	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057775444.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	565	852	5.8e-12	45.8	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919461.1
ATGGCAGCTTATGCAGCTCTTGCTTCTCTCTTGAACAACATTGAGCAGATGATGAGGCATCCTACCCTTTCCACTTCTTTCGACAACATTCAGATCCAATTTCTTGAGGAGAAGGCTGCTTTGTTGCTTGATTTCATTGAGACCTATAACTATGTTGGTGGAGTTAGCGAAGAAGTACAAGATCTCGAAAGCCTAATCGCATCTGCAGCTCATACAGCTGAAGATATGATTGAATCTCACATCGTCAATCAACTCCTTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994416
ATGGCAGCTTATGCAGCTCTTGCTTCTCTCTTGAACAACATTGAGCAGATGATGAGGCATCCTACCCTTTCCACTTCTTTCGACAACATTCAGATCCAATTTCTTGAGGAGAAGGCTGCTTTGTTGCTTGATTTCATTGAGACCTATAACTATGTTGGTGGAGTTAGCGAAGAAGTACAAGATCTCGAAAGCCTAATCGCATCTGCAGCTCATACAGCTGAAGATATGATTGAATCTCACATCGTCAATCAACTCCTTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775444.1
MAAYAALASLLNNIEQMMRHPTLSTSFDNIQIQFLEEKAALLLDFIETYNYVGGVSEEVQDLESLIASAAHTAEDMIESHIVNQLLPLSAHDREAAFSFSLYLQKKRAIEEKNEAAVGDVDQFHGESNLSNFDYLRQIIEDMDAIIHKASELKEKQRFREEHSTPPLTLSLTRTREETAVVGFGDELIQLLDELTGDRSNLHIISIVGMGGMGKTTLAKNIYAHQLIIERFDIRAWATVSHQYNAEQILQQLVFGQGKSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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