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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004277`

染色体: Chr07 坐标: 55278484-55279518 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004277`
名称	SmilChr07G004277
描述	uncharacterized SmilChr07G004277
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	55278484 - 55279518 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994435`
GeneID	`130994435`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994435`
原始查询	`LOC130994435`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF20167 (Retrotransp-rel)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994435

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057775460.1`
2	Chromosome	染色体	0.60000	`XP_057775460.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057775460.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775460.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775460.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:55278496`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr7:55278515`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,B82
`Chr7:55278540`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B8,B80,C80
`Chr7:55278543`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	196	A1,A10,A11,A14,A15,A18,A19,A20,A21,A22,A23,A3,A4,A5,A6,A8,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B110,B111,B113,B114,B115,B117,B118,B119,B12,B121,B122,B124,B125,B126,B127,B129,B130,B131,B132,B134,B135,B136,B137,B139,B140,B15,B17,B19,B2,B21,B22,B23,B26,B27,B28,B29,B31,B32,B33,B35,B36,B37,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B49,B50,B51,B52,B54,B55,B56,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B67,B68,B69,B7,B70,B72,B73,B75,B76,B77,B78,B79,B81,B83,B84,B86,B87,B89,B9,B90,B91,B92,B94,B95,B98,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C17,C19,C20,C21,C22,C23,C24,C25,C26,C27,C28,C30,C31,C34,C35,C36,C38,C4,C40,C41,C42,C43,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C51,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C61,C62,C64,C65,C66,C67,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C77,C78,C79,C8,C81,C82,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D3,D4,D5,D6,D9
`Chr7:55278560`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C3,C64,C66,D10
`Chr7:55278578`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	31	B100,B129,B134,B19,B24,B27,B32,B41,B56,B59,B60,B62,B69,B86,B96,B99,C1,C18,C19,C22,C35,C41,C42,C72,C75,C80,C81,C83,C85,C9,D6
`Chr7:55278579`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B127,C11,C51
`Chr7:55278579`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B127,C11,C51
`Chr7:55278613`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	B27,B71,B9,C38,C64,C71,C78,D9
`Chr7:55278622`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C21,C33,D3
`Chr7:55278636`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,B67,B79
`Chr7:55278652`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775460.1

344 aa

172

344

Retrotransp-rel

PF20167 Retrotransp-rel 64-232 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775460.1`	Pfam	`PF20167`	Retrotransp-rel	Domain	64	232	2.2e-22	80.5	Putative plant retrotransposon-related domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919477.1
ATGGAAGTGGAGGACGAGGAACCCGAAGGCTCCGACATGGAGGTTAGCAAAGCCTTCAAGTCCTTCTTCTACACTGCTGAAGCGGTGAAGTCTTGGCAAAACGTCAAGGAAATGGAGTGCTATAGTGAGCGAAACATTGAGCAAGATTCCTTCAAGATGTTCAATCTTGTGGAATTTTTTAAGGCTTGCCACTTGTTCCAGTCAGTCACCGAGGTGGAGCCCTTTGTGAAATCAGTGGTTCAACTAGTCTACAGCAATCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994435
ATGGAAGTGGAGGACGAGGAACCCGAAGGCTCCGACATGGAGGTTAGCAAAGCCTTCAAGTCCTTCTTCTACACTGCTGAAGCGGTGAAGTCTTGGCAAAACGTCAAGGAAATGGAGTGCTATAGTGAGCGAAACATTGAGCAAGATTCCTTCAAGATGTTCAATCTTGTGGAATTTTTTAAGGCTTGCCACTTGTTCCAGTCAGTCACCGAGGTGGAGCCCTTTGTGAAATCAGTGGTTCAACTAGTCTACAGCAATCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775460.1
MEVEDEEPEGSDMEVSKAFKSFFYTAEAVKSWQNVKEMECYSERNIEQDSFKMFNLVEFFKACHLFQSVTEVEPFVKSVVQLVYSNLTADFGNPRSKKYGKIFYKNKIFTLTPSIINGVLGTPDVKSTKVKNMDKVATVITGGKVWKWLKPMKSSTLSYLYSALFKVMTLNWIVSTNSTVVTQQHGILLYCIGEGLPFNLGQVVFDQIAASSQLSGLPFPSLIFRFLRSQGVKVKDSVQREDIHEYALTSMLFSEGKIAD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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