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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004334`

染色体: Chr07 坐标: 55901796-55905030 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004334`
名称	SmilChr07G004334
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	55901796 - 55905030 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994442`
GeneID	`130994442`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994442`
原始查询	`LOC130994442`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-3
Arabidopsis	`AT5G43470` (RPP8) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834367] identity=27.8; qcov=0.834; evalue=4.61e-66; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=27.2; qcov=0.874; evalue=1.68e-60; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994442

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057775467.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057775467.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775467.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775467.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775467.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:55901816`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr7:55901882`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	29	A10,A9,B10,B11,B113,B119,B122,B123,B131,B132,B22,B45,B52,B58,B60,B71,B73,B76,B78,B87,B88,C15,C16,C26,C39,C55,C65,C70,C83
`Chr7:55901903`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B103,B34,C70
`Chr7:55901903`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B34,C70
`Chr7:55901954`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B44,C9
`Chr7:55901985`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B30,B76,B78
`Chr7:55901985`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B30,B76,B78
`Chr7:55902013`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B71,B73,B86,C16
`Chr7:55902064`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B70,B95,C18
`Chr7:55902067`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B70,B95,C18
`Chr7:55902356`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr7:55902518`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775467.1

998 aa

499

998

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 169-332 aa PF23559 WHD_DRP 418-488 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775467.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	169	332	5.2e-37	127.8	NB-ARC domain
`XP_057775467.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	418	488	4.2e-16	59.4	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919484.1
ATGGCGGCTTATGGAGCTCTGCTTTCTCTTATGCATATCATAGATCGCCTTGAAAAACATCCTTCCCCTCCAATTTCTATCCACAAACAGCAAGTTGAATCTCTCACTGAAAACGTTACCTTCTTGCGGGATTTTCTTGATGCTTATATTTCTCCAGTTGTCGATGACCATGAGGCAGATCCATTGGAGCGTCGCATTGCTGATGCAGTTTATGCAGCTGAGGATGTCATCGAATCCCAAATTGTGCTTCAAATTCATAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994442
ATGGCGGCTTATGGAGCTCTGCTTTCTCTTATGCATATCATAGATCGCCTTGAAAAACATCCTTCCCCTCCAATTTCTATCCACAAACAGCAAGTTGAATCTCTCACTGAAAACGTTACCTTCTTGCGGGATTTTCTTGATGCTTATATTTCTCCAGTTGTCGATGACCATGAGGCAGATCCATTGGAGCGTCGCATTGCTGATGCAGTTTATGCAGCTGAGGATGTCATCGAATCCCAAATTGTGCTTCAAATTCATAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775467.1
MAAYGALLSLMHIIDRLEKHPSPPISIHKQQVESLTENVTFLRDFLDAYISPVVDDHEADPLERRIADAVYAAEDVIESQIVLQIHNRSTIAGKMMSFINLFRALCKCATIEEDFYQDLQQVIEEMNLIKMEAMEIAATAQLQRKVSSTHAGSSSTVKESIMVGFDDVLLQVLDKLTGGQLSRQIIPIMGMGGIGKTTLARHVFEHALVKEHFDICAWTTISQTYNVRETLSEVLFQASGDWGSNLSGGELGLQLFQYLS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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