当前解析结果
SmilChr07G004353| 统一新 Gene ID | SmilChr07G004353 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G004353 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G004353 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 56076709 - 56079116 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130994444 |
|---|---|
| GeneID | 130994444 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994444 |
| 原始查询 | LOC130994444 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994444 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057775469.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057775469.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057775469.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057775469.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057775469.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:56076708 |
CT |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 26 | A21,A23,B101,B103,B133,B140,B16,B4,B40,B5,B78,B87,B89,C10,C14,C21,C34,C41,C43,C45,C47,C50,C58,C7,C84,D4 |
Chr7:56076712 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 26 | A21,A23,B101,B103,B133,B140,B16,B4,B40,B5,B78,B87,B89,C10,C14,C21,C34,C41,C43,C45,C47,C50,C58,C7,C84,D4 |
Chr7:56076729 |
T |
TG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 17 | A23,B133,B140,B16,B4,B40,B5,B78,B87,C21,C43,C45,C47,C50,C58,C7,C84 |
Chr7:56076753 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 13 | A21,A23,B140,B40,B5,B78,B87,C43,C45,C47,C58,C7,C84 |
Chr7:56076842 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B122,B131 |
Chr7:56076870 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B113,B16 |
Chr7:56076871 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 14 | A3,A7,B100,B102,B115,B126,B135,B17,B64,B66,C37,C38,C80,D4 |
Chr7:56076911 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A24,B2,B91,C62 |
Chr7:56076975 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B138,B22,C73 |
Chr7:56076981 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C73 |
Chr7:56077016 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B100,B91,B99 |
Chr7:56077024 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B88,C32,C39,C68,D6 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。