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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004355`

染色体: Chr07 坐标: 56089660-56091676 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004355`
名称	SmilChr07G004355
描述	putative F-box protein At5g52610
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	56089660 - 56091676 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994445`
GeneID	`130994445`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994445`
原始查询	`LOC130994445`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative F-box protein At5g52610
产物	putative F-box protein At5g52610
Arabidopsis	`AT5G50220` (AT5G50220) F-box family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835087] identity=25; qcov=0.597; evalue=2.19e-08; confidence=low
Rice	`Os09g0372900` (OsFbox482) - identity=27.2; qcov=0.398; evalue=3.08e-08; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF08268 (FBA_3); PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994445

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057775470.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057775470.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057775470.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775470.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775470.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:56089739`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B57,C17,C51,C67
`Chr7:56090198`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B75
`Chr7:56090198`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B75
`Chr7:56090245`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr7:56090308`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C54
`Chr7:56090331`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B22,B60,B74,C15,C20
`Chr7:56090337`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,B22
`Chr7:56090694`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,D7
`Chr7:56090716`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B49,C43
`Chr7:56090716`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,C43
`Chr7:56090762`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr7:56090789`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,B41,B62,B78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775470.1

462 aa

231

462

F-box-like

F-box

FBA_3

PF12937 F-box-like 113-150 aa PF00646 F-box 114-152 aa PF08268 FBA_3 188-337 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775470.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	113	150	2.1e-07	31.3	F-box-like
`XP_057775470.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	114	152	1.7e-08	34.8	F-box domain
`XP_057775470.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	188	337	6e-08	32.8	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919487.1
ATGACGCTGCTGGAACCTCCGATACAAGTCAATTTATACTTGATGGAACATGGAGCAAATGCCATACCAAATCTACTGGCATGTGGTAGAGCATTAGGTATTGTAGGGATCATGAATGATTGCTTTGTTGCGGGATTTATAATGTTTATTTGGGTTTTGGGTGGGAAACTGCTGTATTTATTGAGGTTTACTCCGCCGCCGCGTTCAACACACTTCACCGGAAATAGAAAAGCTCAAATGCTTCCTACGAAACCAACGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994445
ATGACGCTGCTGGAACCTCCGATACAAGTCAATTTATACTTGATGGAACATGGAGCAAATGCCATACCAAATCTACTGGCATGTGGTAGAGCATTAGGTATTGTAGGGATCATGAATGATTGCTTTGTTGCGGGATTTATAATGTTTATTTGGGTTTTGGGTGGGAAACTGCTGTATTTATTGAGGTTTACTCCGCCGCCGCGTTCAACACACTTCACCGGAAATAGAAAAGCTCAAATGCTTCCTACGAAACCAACGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775470.1
MTLLEPPIQVNLYLMEHGANAIPNLLACGRALGIVGIMNDCFVAGFIMFIWVLGGKLLYLLRFTPPPRSTHFTGNRKAQMLPTKPTPPRRCFTDDSVSDPHSDILSRESINIVSLPTDLLFEILLRLPADHLYQRARLVCRRWCHIIHSHAFINAQMHGATYGLLLSPLKDYTLPLYVTADADGGIHTSEPNHISKLRFLATCNGLALEYDFKDYRVRLVNPATKQSLLVPRLARGVSYFVLEYGFAYSAASSAYKVIAR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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