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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004412`

染色体: Chr07 坐标: 56738792-56739784 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004412`
名称	SmilChr07G004412
描述	putative disease resistance protein At1g50180
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	56738792 - 56739784 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994460`
GeneID	`130994460`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994460`
原始查询	`LOC130994460`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative disease resistance protein At1g50180
产物	putative disease resistance protein At1g50180
Arabidopsis	`AT1G50180` (AT1G50180) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841440] identity=40.5; qcov=0.988; evalue=4.95e-59; confidence=medium
Rice	`Os11g0633500` - identity=28.6; qcov=1.01; evalue=1.68e-31; confidence=low
GO	GO:0006952 (defense response); GO:0043531 (ADP binding)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF13191 (AAA_16); PF18052 (Rx_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994460

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057775485.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775485.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775485.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775485.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775485.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:56738812`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B46,C61
`Chr7:56738814`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C1,C41,C55,C58,C7
`Chr7:56738822`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,C69
`Chr7:56738857`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C28,C70
`Chr7:56738870`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,C21
`Chr7:56738920`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B100,B11,B17,B92,B99,C21,C71
`Chr7:56738938`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B122,B131,B140,B15,B93
`Chr7:56738946`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,B3
`Chr7:56738954`	`AAT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C2
`Chr7:56738954`	`AAT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C2
`Chr7:56738957`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B22,C28,C58
`Chr7:56738979`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775485.1

330 aa

165

330

Rx_N

AAA_16

NB-ARC

PF18052 Rx_N 5-89 aa PF13191 AAA_16 168-285 aa PF00931 NB-ARC 172-319 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775485.1`	Pfam	`PF18052`	Rx_N	Domain	5	89	1.3e-19	70.8	Rx N-terminal domain
`XP_057775485.1`	Pfam	`PF13191`	AAA_16	Domain	168	285	2.3e-08	35.5	AAA ATPase domain
`XP_057775485.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	172	319	3.5e-31	108.8	NB-ARC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919502.1
ATGGCAGAAGCAGTGGTGTCGACTGCTCTAGAAACCTTGCGCGATTTGTTGTTGGAAGAGGCAAAGTTTTTATATGGTGTGGGCGATGAAGTGAAGGAGCTCGAGATCCAGCTCAAAGAGATGAAGTGTCTTCTCAAAGATGCCGACAGAAGACGACATGAAAATGAAACCATTTTCAATTGGATCTCAGAGATCAAAGATCTTGTGTACAGAGCCGAAGCTGCCATTGAAAGACACGCAGCTTATCAAGTGACTTCAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994460
ATGGCAGAAGCAGTGGTGTCGACTGCTCTAGAAACCTTGCGCGATTTGTTGTTGGAAGAGGCAAAGTTTTTATATGGTGTGGGCGATGAAGTGAAGGAGCTCGAGATCCAGCTCAAAGAGATGAAGTGTCTTCTCAAAGATGCCGACAGAAGACGACATGAAAATGAAACCATTTTCAATTGGATCTCAGAGATCAAAGATCTTGTGTACAGAGCCGAAGCTGCCATTGAAAGACACGCAGCTTATCAAGTGACTTCAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775485.1
MAEAVVSTALETLRDLLLEEAKFLYGVGDEVKELEIQLKEMKCLLKDADRRRHENETIFNWISEIKDLVYRAEAAIERHAAYQVTSRRKRGLKQLLRRCSCSLEEYKSIHQLGLEISPIKSRLERINKEMLESGIKKSIINNTDEGESSSANNRARKSFPKFEIGDCFVGMKDELKQLLHLLVEDEKHRVISVWGMGGSGKTTIAKKLYNDNNTSFDLCAWVCISQQCQSFQSVWNDVLMQLQHQNTKDGPKIRDDVTSL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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