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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004424`

染色体: Chr07 坐标: 56838720-56840234 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004424`
名称	SmilChr07G004424
描述	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	56838720 - 56840234 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994463`
GeneID	`130994463`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994463`
原始查询	`LOC130994463`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
产物	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
Arabidopsis	`AT5G35450` (AT5G35450) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833508] identity=30.2; qcov=0.984; evalue=2.88e-52; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=36.4; qcov=0.627; evalue=1.19e-58; confidence=medium
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994463

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057775489.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775489.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775489.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775489.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057775489.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:56838745`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B97
`Chr7:56838745`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B97
`Chr7:56838836`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr7:56838845`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B109,B119,B93,C48
`Chr7:56838846`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr7:56838865`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr7:56838866`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B115,B6,C25,C51,D5
`Chr7:56838920`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B49,C40
`Chr7:56838930`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr7:56838948`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,C36,C66
`Chr7:56839009`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B10,B24,B53,B9,C25,D5
`Chr7:56839124`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775489.1

504 aa

252

504

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 204-366 aa PF23559 WHD_DRP 452-497 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775489.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	204	366	7.1e-40	137.1	NB-ARC domain
`XP_057775489.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	452	497	4.5e-09	36.9	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919506.1
ATGGCGGCTTATGGAGCTCTGGTTTCTCTTATGCATATCATAGATCGCCTTGAAAAACATCCTTCCCCTCCAATTTCTATCCACAAACAGCAAGTTGAATCTCTCACTCAAAATGTGACCTTCTTGCAGGAATTTCTTGATGCTTATATTTCCCCAGTTGTGGATGACCATGAGGCGGATCCATTGGAGCGTCGCATTGCTGATGCAGTTTATGCAGCTGAGGATGTCATCGAATCCCAAATTGTGCTTCAAATTGATAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994463
ATGGCGGCTTATGGAGCTCTGGTTTCTCTTATGCATATCATAGATCGCCTTGAAAAACATCCTTCCCCTCCAATTTCTATCCACAAACAGCAAGTTGAATCTCTCACTCAAAATGTGACCTTCTTGCAGGAATTTCTTGATGCTTATATTTCCCCAGTTGTGGATGACCATGAGGCGGATCCATTGGAGCGTCGCATTGCTGATGCAGTTTATGCAGCTGAGGATGTCATCGAATCCCAAATTGTGCTTCAAATTGATAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775489.1
MAAYGALVSLMHIIDRLEKHPSPPISIHKQQVESLTQNVTFLQEFLDAYISPVVDDHEADPLERRIADAVYAAEDVIESQIVLQIDNRSKIPGKMSSFINLFRARCKCSTIDRNELEVGVNAAEDFYHDLQQVIEEMNSISTAADQLQRKVSSTHAASSSTVIKKDVLEIVAAAQLPRKVSSTHAASSSSVKESMMVGFKEVLLEVLDKLTGGQRSRKIIPIMGMGGIGKTTLARHLFEHALVKEHFDICAWTTISQTYN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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