当前解析结果
SmilChr01G003611| 统一新 Gene ID | SmilChr01G003611 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G003611 |
| 描述 | heavy metal-associated isoprenylated plant protein 24-like |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 54660267 - 54661448 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130994467 |
|---|---|
| GeneID | 130994467 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130994467 |
| 原始查询 | LOC130994467 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | heavy metal-associated isoprenylated plant protein 24-like |
| 产物 | heavy metal-associated isoprenylated plant protein 24-like |
| Arabidopsis | AT4G08570 (AT4G08570)Heavy metal transport/detoxification superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826418] identity=64.7; qcov=1.01; evalue=5.08e-64; confidence=high |
| Rice | Os03g0383900- identity=51.6; qcov=1.05; evalue=8.03e-52; confidence=high |
| GO | GO:0046872 (metal ion binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00403 (HMA) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130994467 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 1.00000 | XP_057775494.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057775494.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057775494.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057775494.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057775494.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:54660834 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B90 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057775494.1PF00403
HMA 31-86 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057775494.1 |
Pfam | PF00403 |
HMA | Domain | 31 | 86 | 5.4e-12 | 46.6 | Heavy-metal-associated domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。