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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004519`

染色体: Chr07 坐标: 57866717-57867352 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004519`
名称	SmilChr07G004519
描述	ankyrin repeat-containing protein At2g01680-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	57866717 - 57867352 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994496`
GeneID	`130994496`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994496`
原始查询	`LOC130994496`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ankyrin repeat-containing protein At2g01680-like
产物	ankyrin repeat-containing protein At2g01680-like
Arabidopsis	`AT2G01680` (AT2G01680) Ankyrin repeat family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814697] identity=34.1; qcov=0.764; evalue=1.94e-13; confidence=low
Rice	`Os03g0281100` (OsSTA96) - identity=30.9; qcov=0.764; evalue=4.86e-13; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00023 (Ank); PF12796 (Ank_2); PF13637 (Ank_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994496

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057775522.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057775522.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057775522.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775522.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775522.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:57866756`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B19,B72,C31
`Chr7:57866826`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B83,C82
`Chr7:57866858`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B140
`Chr7:57866858`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr7:57866894`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C55,D5
`Chr7:57866898`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B3,B78,C52
`Chr7:57866898`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B3,B78,C52
`Chr7:57866926`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	A20,B18,B43,B62,B64,B66,B95,C16,C3,C33
`Chr7:57866929`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	A20,B18,B43,B62,B64,B66,B95,C16,C3,C33
`Chr7:57866936`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr7:57866983`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B12,B78,C81
`Chr7:57866983`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B12,B78,C81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775522.1

161 aa

161

Ank_2

Ank

Ank_4

PF12796 Ank_2 5-90 aa PF12796 Ank_2 108-160 aa PF00023 Ank 112-132 aa PF13637 Ank_4 116-160 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775522.1`	Pfam	`PF12796`	Ank_2	Repeat	5	90	2.5e-18	67.2	Ankyrin repeats (3 copies)
`XP_057775522.1`	Pfam	`PF12796`	Ank_2	Repeat	108	160	2.5e-18	67.2	Ankyrin repeats (3 copies)
`XP_057775522.1`	Pfam	`PF00023`	Ank	Repeat	112	132	1e-13	51.4	Ankyrin repeat
`XP_057775522.1`	Pfam	`PF13637`	Ank_4	Repeat	116	160	1.1e-14	54.9	Ankyrin repeats (many copies)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919539.1
ATGGCTGCAGAACTCTACGATGCTGTATACAAAGGGGATGTAACAAAATTTCATAAACTAGTTGAACAAGATCCATATCTCGTTGAAACTGCTTCATTTTCATGTTCAAGAAATGTTCTTCACATCGCAACAATGCGGGGACAGACAGCCATGGTGGAAGAGGTGCTGAATATGAATCCGTGGCTTGCTCGGAGTTTAGACTCCCAACAATCATCGCCTCTGCACATAGCAGCAGCAGAAGGGCGCTTCGAGATCTCGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994496
ATGGCTGCAGAACTCTACGATGCTGTATACAAAGGGGATGTAACAAAATTTCATAAACTAGTTGAACAAGATCCATATCTCGTTGAAACTGCTTCATTTTCATGTTCAAGAAATGTTCTTCACATCGCAACAATGCGGGGACAGACAGCCATGGTGGAAGAGGTGCTGAATATGAATCCGTGGCTTGCTCGGAGTTTAGACTCCCAACAATCATCGCCTCTGCACATAGCAGCAGCAGAAGGGCGCTTCGAGATCTCGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775522.1
MAAELYDAVYKGDVTKFHKLVEQDPYLVETASFSCSRNVLHIATMRGQTAMVEEVLNMNPWLARSLDSQQSSPLHIAAAEGRFEISRKLLVARLSRYEPESRLPAMERVGRGQTVLHLCVKHGKLETLKVLVGKLWELVEAVDEDGETLLHLAVRSTQLES

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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