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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004575`

染色体: Chr07 坐标: 58535332-58536933 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004575`
名称	SmilChr07G004575
描述	late blight resistance protein R1-A-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	58535332 - 58536933 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994514`
GeneID	`130994514`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994514`
原始查询	`LOC130994514`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	late blight resistance protein R1-A-like
产物	late blight resistance protein R1-A-like
Arabidopsis	`AT1G53350` (AT1G53350) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841771] identity=22.9; qcov=0.927; evalue=1.76e-14; confidence=weak
Rice	`Os06g0286500` (Nbs1-Pi9) - identity=25.8; qcov=1.03; evalue=8.27e-19; confidence=low
GO	GO:0006457 (protein folding); GO:0043014 (alpha-tubulin binding)
KEGG	-
Pfam	PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994514

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057775539.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057775539.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057775539.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775539.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057775539.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:58535338`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr7:58535366`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B113,B120,B65,B9
`Chr7:58535376`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr7:58535465`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B37,D3
`Chr7:58535465`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B37,D3
`Chr7:58535474`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C5
`Chr7:58535474`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C5
`Chr7:58535498`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B115,D4
`Chr7:58535498`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B115,D4
`Chr7:58535525`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B117,B12,B55,C23
`Chr7:58535555`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B114
`Chr7:58535595`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	13	B100,B12,B3,B38,B59,B70,B81,B83,C11,C46,C49,C61,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775539.1

533 aa

266

533

WHD_DRP

PF23559 WHD_DRP 3-72 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775539.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	3	72	5.7e-15	55.8	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919556.1
ATGGGTGTTTTTGATGAAGATCGTTCAATTCGTGCCTCAATGCTGAAGAAGCTATGGGTTTCTGAAGGATTTTTAAAACCAACGAGTACTGGCAAACGCTTGGAAACAATTGCGCATGAGTACTTAATGGAATTGGTCGATAGAAATCTCATAATAGTTGATAAGTTGGGGTCTATTGGAAATGTCAAATACTGTAGAATTCATGATTTGTTGAGGGGCGTGTGCTTGAAAGAAGTTGAAAAGGAGAGGTTTTATCATAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994514
ATGGGTGTTTTTGATGAAGATCGTTCAATTCGTGCCTCAATGCTGAAGAAGCTATGGGTTTCTGAAGGATTTTTAAAACCAACGAGTACTGGCAAACGCTTGGAAACAATTGCGCATGAGTACTTAATGGAATTGGTCGATAGAAATCTCATAATAGTTGATAAGTTGGGGTCTATTGGAAATGTCAAATACTGTAGAATTCATGATTTGTTGAGGGGCGTGTGCTTGAAAGAAGTTGAAAAGGAGAGGTTTTATCATAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775539.1
MGVFDEDRSIRASMLKKLWVSEGFLKPTSTGKRLETIAHEYLMELVDRNLIIVDKLGSIGNVKYCRIHDLLRGVCLKEVEKERFYHIIGKSPSVIDNEPRRRVVFQNAGSRVTSEVSGSLPHARSIILCDDRKDFETPHDFRLLRTFKAYDRDTSSLTYDYLLGEYYFNFTTASGLHFLGDVFELVNSRYLAVRLHRDTGFPSSINLLWNLNTLILHSQTSADQIWDTSRTRIFHGLGHGHVVPIEIWQMHQLRHLVFMR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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