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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G004610`

染色体: Chr07 坐标: 58884605-58886545 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G004610`
名称	SmilChr07G004610
描述	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	58884605 - 58886545 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130994525`
GeneID	`130994525`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130994525`
原始查询	`LOC130994525`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
产物	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
Arabidopsis	`AT1G53350` (AT1G53350) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841771] identity=26.2; qcov=0.967; evalue=2.14e-43; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=27.9; qcov=0.92; evalue=1.71e-46; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130994525

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057775552.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057775552.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057775552.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057775552.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057775552.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:58884648`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr7:58884674`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	B40,C31,C33,C62,C75,C80,D5
`Chr7:58884924`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B126,B131,B55,B88,B92,C80
`Chr7:58884927`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr7:58884928`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B126,B131,B55,B88,B92,C80
`Chr7:58884955`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C29
`Chr7:58884955`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29
`Chr7:58884964`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,B78,C15
`Chr7:58884976`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B137,C50,C86
`Chr7:58884980`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B15,B19,B78,C15,C29
`Chr7:58885024`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B15,B19,B78,C15,C29
`Chr7:58885034`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B131,B137,C50,C85,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057775552.1

646 aa

323

646

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 1-65 aa PF23559 WHD_DRP 151-221 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057775552.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	1	65	4.5e-13	49.9	NB-ARC domain
`XP_057775552.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	151	221	1.6e-16	60.8	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057919569.1
ATGGATGATATATGGAGTATACAGGTGTGGGAAAAGATCAGATCTTTCTTTCCTGATTACAATAATGGTAGTCGAATAATCATAACAACTAGGCTATCAAATTTGACTTCGTACTTGGGTGAGTCTTATGGCGTTGGTATGAAATTTCTAGATGAGGCTAGTAGTTGGGATTTGTTCACCAACATTGTGTTTGGGGGAGAAAGTTTTCCTCCTGAGTTGGAGGATATTGGAAAGAATATTGTAGCAAATTGTAAAGGGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130994525
ATGGATGATATATGGAGTATACAGGTGTGGGAAAAGATCAGATCTTTCTTTCCTGATTACAATAATGGTAGTCGAATAATCATAACAACTAGGCTATCAAATTTGACTTCGTACTTGGGTGAGTCTTATGGCGTTGGTATGAAATTTCTAGATGAGGCTAGTAGTTGGGATTTGTTCACCAACATTGTGTTTGGGGGAGAAAGTTTTCCTCCTGAGTTGGAGGATATTGGAAAGAATATTGTAGCAAATTGTAAAGGGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057775552.1
MDDIWSIQVWEKIRSFFPDYNNGSRIIITTRLSNLTSYLGESYGVGMKFLDEASSWDLFTNIVFGGESFPPELEDIGKNIVANCKGLPLSIATIGGLLAKSERTRKYWGRIEQNLNSIVIANNDKFCLKILRMSYTFLPNYLKPCFLYMGVFEEDRSIRVSMLKKLWVSEGFLKPVSGKCWETIAEEYLNELVDRNLILVDELGFSGNVKYCKIHDLLRDVCLKEVEKERFYRIIEKSPSVIDTERRVVFENAGSRVIRE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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